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异构数据查询是数据空间必须提供的一种重要的数据服务。本文介绍一种基于基本信息单元的查询机制。考虑数据空间中异构数据内部的相关性和用户活动相关性，抽取相关的数据，生成一个个基本信息单元，为多源异构异质数据建立一个基于基本信息单元的倒排索引，以提供丰富的内容查询和数据浏览。实验结果表明：利用基于基本信息单元的查询机制，系统能返回语义信息相对比较完整的查询结果。