羊肚菌营养丰富、味道鲜美,具有很高的经济和科研价值。近年来我国羊肚菌栽培面积大幅增加,但是产量仍然不稳定,主要原因在于很多基础生物学问题不明。在羊肚菌生活史中,菌核具有非常重要的地位,菌核量也是生产中菌种质量的重要评价标准,然而羊肚菌菌核形成机制缺乏深入研究。本研究以梯棱羊肚菌Morchella importuna为主要研究对象,在菌核形成影响研究的基础上,建立了菌核稳定形成的技术体系;通过对菌核形成过程观察和各阶段活性氧（ROS）分布的检测,发现ROS对梯棱羊肚菌的菌核形成具有重要作用,高ROS区域细胞逐渐老化而低ROS区域细胞形成菌核。进一步通过对菌核形成起始阶段的菌核和菌丝区域样品进行转录组测序分析,发现两者在基因表达水平上具有较大差异。GO和KEGG分析表明菌丝细胞具有更旺盛的代谢活动,而在菌核细胞中转录和DNA修复等过程更活跃。过氧化氢合成相关基因总体表达量在菌丝区域高,而H2O2清除相关基因总体表达量在菌核区域高,这种趋势会导致菌丝区域积累更高的H2O2。过氧化氢诱导信号途径相关基因在两个区域的表达水平差别不大,但是下游转录因子MSN2的靶基因在菌丝和菌核中的表达水平差异较大,说明MSN2通过调节这些靶基因加强了菌核应对ROS压力时的反应。同时也发现,多个小分子热激蛋白在菌核细胞中上调表达。本研究表明不同氧化压力下的细胞具有不同的分化命运,外界ROS信号对其发挥重要的调控作用,菌核细胞比菌丝细胞对于ROS胁迫具有更高的耐受性。