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头颈部的特殊感染症包括很多，其中较为常见的主要有真菌病、梅毒、鼻硬结症、结核和病毒感染等。与EB病毒感染相关的疾病主要包括鼻咽癌及鼻咽癌样癌，NK/T细胞淋巴瘤、Burkitt淋巴瘤、传染性单核细胞增多症、霍奇金淋巴瘤、儿童系统性EB病毒阳性T细胞淋巴组织增殖性疾病等。I型单纯疱疹病毒(HSVl)可引起疱疹性龈口炎。最近有报告认为HPV感染与头颈部进展期癌及其预后有明显相关性。比较常见的口腔致病菌是念珠菌、HSV1和放线菌。