基于12S rRNA序列研究龟鳖类的系统进化特征

来源 :2010年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:onlysimon
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  为研究龟鳖类的系统进化关系,以期为龟鳖类的保护和合理开发利用提供基础资料,测定了15种龟类线粒体12S rRNA基因片段的序列.比对后获得一致序列长为433bp,有191个变异位点,总变异率为43.2%,其中简约信息位点108个.A、T、G、C的平均含量分别为21.46%、34.42%、25.85%和18.27%.A+T含量(55.9%)高于G+C含量(44.2%).在433个核苷酸位点中,有插入/缺失35个,转换为34,颠换为21,转换/颠换比率为1.67.与NCBI上其它一些龟鳖的序列进行比对后,得到414bp的一致序列,其中236个为变异位点,总变异率为57.00%;简约信息位点181个.A、T、G、C的平均含量分别为35.7%、22.2%、18.1%、24.0%.A+T含量(57.9%)高于G+C含量(42.1%).
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