基于高通量测序的甜菜内生细菌多样性

来源 :纪念中国微生物学会成立六十周年大会暨2012年中国微生物学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qinyue_love
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的:揭示甜菜内生细菌多样性及其演替规律和动态变化。方法:采用液氮研磨法分别提取甜菜组织总DNA,采用通用引物L-V3和R-V3扩增内生细菌16S rDNA的V3区,通过华大基因公司进行12个甜菜内生菌样品的16S rDNA的V3区的Illumina高通量测序平台测序,并进行相应的高级信息学分析。结果:1、甜菜内生细菌具有较高的多样性。其中内生细菌优势菌属为Acidobacteria,Sphingobacteria,Gemmatimonadetes,Alphaproteobacteria,Betaproteobacteria,Deltaproteobacteria,Gammaproteobacteria。2、PCA结果表明样品中内生细菌的相对含量主要由2个主成分决定,即PC1和PC2。3、聚类分析表明甜菜同一生育期内生细菌群落结构相似。在纲水平上甜菜内生细菌的一些类群表现出明显的演替规律。
其他文献
  为了研究亚家族GH13_37成员是否具有某种独特的、己知a-淀粉酶中均没有的催化特性,选择AmyP进一步进行了研究。结果表明AmyP是一个生淀粉水解酶,而且对大米生淀粉展示出显
本文在充分了解固化剂作用机理的基础上,阐述了固化剂的常见类型,并对农村公路固化土路面施工技术要点进行了分析与探究.
  本研究利用藤黄微球菌的信号蛋白分子Rpf,同时采用最大可能数法(MPN)、平板分离法、DGGE解析法等对来自人迹罕至的海边、森林和公园土壤,新疆沙漠土壤,污水处理系统等计80余
会议
  本文阐述了Red/ET重组克服了传统方法对限制性酶切位点的依赖,不受DNA分子大小的限制,只要很短的同源臂就能介导高效的同源重组。利用全长的RecE/RecT重组酶介导的同源重组
会议
长期以来,我国公路工程以载重大、安全、舒适等优势,使道路交通在经济市场环境下发挥着重要的作用.随着国民经济的高速发展,为满足道路交通运输需求,必须重视公路路基路面质
游戏是儿童的天性,幼儿园一日活动中应做到游戏课程化.领会《3-6岁儿童学习与发展指南》精髓,树立正确的游戏观.从了解游戏课程化概念、游戏课程化的特点、落实策略三方面入
  本文主要从胞内能量及氧化还原状态角度阐述其在模式生物酿酒酵母转录因子GAL4转录活化过程中的作用机制;本文还对纤维素降解模式菌瑞氏木霉中可能参与启动纤维素酶快速诱
  目的:克隆、表达及纯化腾冲嗜热芽孢杆菌MB4中丙氨酸消旋酶,表征其酶学特性,探索酶蛋白活性通道中不保守氨基酸位点的作用机制。方法:利用PCR技术、分子筛层析法和动态光散射
  本实验室对来自芝田硫化叶菌的Ssh10b蛋白进行了研究,前期研究发现,Ssh10b在体外与双链DNA、单链DNA以及RNA的结合亲和力相似,但在细胞内特异结合有结构的RNA。这一发现为研
伴随我国水利工程建设规模的不断扩大,为充分发挥水利工程使用功能,对工程防渗提出了更高的要求.堤坝作为水利工程的主要内容之一,若出现渗漏问题,维修难度极大.为此,必须重