研究背景:核酸适配体(Aptamer)是指拥有小配体特殊结合位点的RNA序列,于1990年被人们用SELEX技术发现并命名。Aptamer与细胞因子等生物分子特异性结合的亲和力比抗体高,在生物医学领域已得到了广泛应用。目前发现的Aptamer均是人工合成和筛选的,而体内存在的micro RNA和非编码RNA等核酸分子是否具有Aptamer的作用,还尚未明确。研究目的 :本研究拟通过生物信息学技术,利用已知的人类微小RNA(micro RNA)和非编码RNA数据库,将已报道的Aptamer序列与天然存在的micro RNA和非编码RNA序列进行比较,发现其中的天然Aptamer样序列,建立天然核酸适配体样分子数据库。同时,通过生物学的技术研究,验证天然Aptamer样分子的生物学功能。方法 :利用BLAST方法将1562条已有的核酸适配体在NCBI Refseq数据库等天然的核酸数据库中进行比对,将匹配率大于等于80%的天然序列定义为天然aptamer样分子,并对其信息进行整合与汇总,最终得到了57条天然aptamer,并建立天然aptamer样分子的线上数据库(http://www.alsdb.org/)。分别选择可以与Ep CAM和VEGF特异性结合的天然aptamer样分子,分别采用了免疫荧光标记、ELISA和光学表面等离子共振(SPR)实验等技术,对其与各自靶分子结合的能力进行分析,发现其结合靶分子的亲和力比人工筛选的Aptamer弱,但较相应的抗体强。结论 :人类RNA数据库中存在与Aptamer序列相似的天然aptamer样分子,这些序列也可以与相应的靶分子结合,并且具有较强的亲和力。这表明,利用现有的核酸适配体在人类核酸数据库中进行序列比对可作为发现Aptamer的新方法。人类天然aptamer样分子的存在也可以为核酸分子在人体免疫系统应答和调控中的作用研究提供新的思路。