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对于高可靠系统的设计，不完全覆盖会对整个系统的可靠性产生重要影响，而准确的估计覆盖率参数是非常重要的。本文首先提出了基于故障注入技术的覆盖率参数估计的两级抽样技术，作为覆盖模型的出口概率，接着给出了利用组合模型计算基于不同覆盖模型的系统可靠性，最后以一个三模系统为例，说明了两级抽样的覆盖率参数估计技术的应用及不完全覆盖对系统可靠性的影响，结果显示不同的覆盖模型对系统可靠性产生重要影响。