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益生菌已经被很多研究证实能够改善宿主的健康。本研究的目的是调查复合益生菌制剂(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus plantarum P-8)对奶牛产奶量、牛奶成分以及奶牛肠道菌群的影响。采用太平洋公司的单分子实时测序技术(SMRT technology,三代测序技术)测定牛奶粪便样品16S r RNA基因序列全长评估益生菌干预后对奶牛肠道菌群的变化。结果发现,益生菌补充显著的增加奶牛产奶量的同时,牛奶中的免疫球蛋白、乳铁蛋白、溶菌酶和过氧化氢酶都有显著地增加,而乳中的体细胞数显著降低(P<0.01)。但益生菌并没有使乳中的蛋白质、脂肪和乳糖的含量发生明显变化(P>0.05)。虽然给奶牛饲喂益生菌没有显著的改变奶牛肠道菌群的丰度和多样性,但我们发现,实验组在饲喂益生菌后大部分瘤胃发酵细菌(Bacteroides,Roseburia,Ruminococcus,Clostridium,Coprococcus和Dorea)和一些有益的细菌(Faecalibacterium prausnitzii)含量显著高于对照组,而一些机会致病菌如:Bacillus cereus,Cronobacter sakazakii和Alkaliphilus oremlandii明显低于度招组。此外,我们还发现奶牛肠道中的细菌和产奶量、牛奶的一些成分有相关性。总之,我们的研究发现益生菌能够提高产奶量的同时改善牛奶的质量。