【摘 要】
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本文采用二阶Z变换对转录因子结合位点序列进行建模。在建模的过程中充分考虑了DNA序列中各位点碱基之间的依赖性，对以往所采用的经典模型进行了一定的改进。在建模过程中采用
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本文采用二阶Z变换对转录因子结合位点序列进行建模。在建模的过程中充分考虑了DNA序列中各位点碱基之间的依赖性，对以往所采用的经典模型进行了一定的改进。在建模过程中采用二阶Z变换来表示各个碱基之间的依赖性。此方法先把多条具有相同长度的转录因子结合位点序列转化为一个24维的向量模型，同时把待识别的各条序列也转化为相应的24维向量，然后计算待识别序列对应的向量与模型向量之间在各个分量上的角度，从而得到一个24维的角度向量。最后利用训练集训练BP人工神经网络，对真正的转录因子结合位点进行识别。对大肠杆菌的四类转录因子结合位点数据进行实验得到的结果表明，此方法可以有效地提高转录因子结合位点识别的准确性和特异性。
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