【摘 要】
:
前体mRNA的可变剪接是扩大真核生物蛋白质组多样性的重要基因调控机制。可变剪接的错误调节可以引起多种人类疾病。虽然对于可变剪接的调控机制已经进行了大量研究工作,但人
论文部分内容阅读
前体mRNA的可变剪接是扩大真核生物蛋白质组多样性的重要基因调控机制。可变剪接的错误调节可以引起多种人类疾病。虽然对于可变剪接的调控机制已经进行了大量研究工作,但人们对于蛋白质-RNA网络调控可变剪接的多样性和复杂性还缺乏全面的认识。最近一些全基因组范围的可变剪接机制研究取得了重大进展,这为可变剪接特征模型的构建提供了方法和数据支持。本文的主要研究目标是对可变剪接的序列特征进行整理,建立全基因组可变剪接的特征模型,以此来分析可变剪接事件,揭示可变剪接事件的调控机制。本文首先对可变剪接的生物学机制进行阐述,给出了不同数据下可变剪接研究方法的总体框架,为可变剪接的特征分析提供了生物学依据。第二,系统地介绍了外显子芯片的设计原理和分析流程,具体说明了利用外显子芯片数据分析可变剪接事件的方法,为可变剪接的特征分析提供了技术支持。第三,利用已有影响可变剪接的特征,综合使用外显子芯片表达数据,应用一种基于线性回归和信息论的方法建立可变剪接特征的模型,获得了包含146个特征的可变剪接特征集合。第四,应用此特征集合对可变剪接事件进行预测,预测率较之以往的方法所有提高。最后,建立了AS2Disease数据库,对数据库中的数据进行简单统计分析,并利用可变剪接外显子与疾病的关系数据对特征集合的生物合理性进行了部分验证。综上,本文建立的可变剪接特征模型可以有效地标识可变剪接事件,说明了序列特征对可变剪接事件的影响,部分地揭示了可变剪接的调控机制。
其他文献
本论文完成了两点式电阻触摸屏系统设计,包括硬件和软件设计及算法实现。提出了采用蛇形电阻来取代传统的多线式触摸电阻屏的方法,来实现单点/双点触摸屏结构。通过对整个系
在和谐人机交互与人工智能领域,情感计算作为一个新的研究方向,日益受到关注。本文采用计算机视觉的方法,让家庭服务机器人通过对人脸表情的识别来认知人类情感,进而做出相应
动态联盟将成为新世纪企业超越传统竞争的新模式的观点,已被学术界和企业界广泛接受,然而,企业如何得到联盟信息,得知信息后如何进行联盟,谁来对联盟进行管理,保障企业的根本
随着汽车工业的迅速发展,汽车控制部件越来越多,控制系统越来越复杂,导致汽车控制软件的开发引入了很多问题,比如重复性开发,软件开发效率低,系统的移植性和扩展性问题。为了
远程实验室可以分为虚拟现实实验室和远程控制实验室。虚拟实验室是采用虚拟仿真技术实现的开放式实验系统,虚拟实验室由虚拟试验台、虚拟器材库和开放式实验管理系统组成,几
“质量即生命,责任重泰山”,工程质量一直都是工程建设过程中关注的焦点,而对工程项目建设过程的质量监督是保证工程质量的有效手段,传统的工程质量监督主要面向业务设计,面
随着无线传感器网络(Wireless Sensor Network,以下简称为WSN)的广泛应用,针对WSN的优化设计方法也得到了越来越多的关注。WSN由于其传感器节点自身能力以及无线传输方式的限
随着互联网上信息的爆炸式增长,通用的搜索引擎很难满足特定用户“专、精、深”的查询需求,在此情况下垂直搜索引擎应运而生。本文研究了垂直搜索引擎的几项主要技术:主题爬虫
随着人工智能和物联网的高速发展,动态目标的定位技术得到了广泛的关注。尽管卫星导航定位技术在户外非常成熟,但是由于建筑物的遮挡,在室内环境下其定位效果并不理想。基于WLAN