【摘 要】
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研究背景:瘢痕疙瘩是临床上常见的一种发生于皮肤创伤后,由多种病理机制介导的伤口修复异常而形成的病理性瘢痕。瘢痕疙瘩的特点是成纤维细胞过度增殖,以及细胞外基质成分(尤其是胶原蛋白)过度聚积。瘢痕疙瘩在真皮和皮下组织呈过度生长,扩展超出了原始创面的范围,并持续性侵犯邻近正常皮肤组织,皮损呈红色或暗红色瘤样增生、隆起。瘢痕疙瘩治疗效果往往不佳,且存在较高的复发率。瘢痕疙瘩不仅会对患者的外观造成影响,还会
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研究背景:瘢痕疙瘩是临床上常见的一种发生于皮肤创伤后,由多种病理机制介导的伤口修复异常而形成的病理性瘢痕。瘢痕疙瘩的特点是成纤维细胞过度增殖,以及细胞外基质成分(尤其是胶原蛋白)过度聚积。瘢痕疙瘩在真皮和皮下组织呈过度生长,扩展超出了原始创面的范围,并持续性侵犯邻近正常皮肤组织,皮损呈红色或暗红色瘤样增生、隆起。瘢痕疙瘩治疗效果往往不佳,且存在较高的复发率。瘢痕疙瘩不仅会对患者的外观造成影响,还会给患者带来瘙痒、疼痛,严重影响患者的心理及生理健康。目前多数研究者认为遗传因素是瘢痕疙瘩发病的重要因素,全基因组关联分析(GWAS)在人类染色体1q41发现了一个单核苷酸多态性位点(SNP)rs873549作为瘢痕疙瘩的一个易感性位点,且此位点在日本人群和中国人群中都存在,但此位点未有深入研究,可能原因是该位点位于基因间区域,附近不存在编码蛋白的基因。但事实上,该区域的易感位点SNP rs873549与瘢痕疙瘩发病最显著相关,提示该位点以及与之相关的产生强连锁不平衡(LD)的SNP位点均可能在瘢痕疙瘩发病中发挥重要作用。研究目的:探讨单核苷酸多态性位点SNP rs873549以及与其存在强连锁的单核苷酸多态性位点SNP rs1348270,在瘢痕疙瘩发病过程中的遗传学作用和下游分子生物学机制。研究方法:1.采用Haploview、DHS、ENCODE等生物信息学方法对与rs873549强连锁的SNP位点进行分析,并筛选出位于顺式作用元件中,可能调控附近基因表达的SNP位点。2.通过CRISPR-Cas9技术剪切了上述重要SNP位点所在顺式作用元件,并利用qRT-PCR技术分析以上易感位点附近基因的表达水平,分析以上位点对附近基因的调控作用。3.通过染色体构像捕获研究了含有rs1348270的增强子和成纤维细胞中的lncRNA DEIK(Down Expressed In Keloids,原名 RP11-400N13.1)启动子之间的相互作用,并采用双荧光素酶报告基因的实验方法来检测SNP位点rs1348270所在的增强子的活性。4.通过敲低实验探讨lncRNADEIK在瘢痕疙瘩中的作用,通过RNA-seq研究DEIK调控胶原、POSTN和COMP表达的机制。研究结果:与SNP rs873549强连锁的SNP rs1348270位于一个增强子上,与长链非编码RNADEIK的启动子存在相互作用。该位点的风险变异与瘢痕疙瘩中DEIK的启动子-增强子相互作用去除和DEIK表达下调有关。机制上,DEIK下调可以通过上调BMP2,进一步增加胶原,POSTN和COMP的表达。此外,相关性分析显示,瘢痕疙瘩和正常人的成纤维细胞中DEIK表达与BMP2、POSTN和COMP的表达呈负相关。研究结论:我们的实验结果表明,瘢痕疙瘩的风险变异位点SNP rs1348270位于一个增强子中,与瘢痕疙瘩中DEIK的下调有关,而DEIK的下调可通过BMP2的上调来增加成纤维细胞中胶原、POSTN和COMP的表达。这些发现将帮助我们更深入地了解在瘢痕疙瘩发病过程中SNP的遗传学作用和分子生物学机制,有利于帮助瘢痕疙瘩易感人群的筛查,为瘢痕疙瘩的治疗提供新的思路。
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