【摘 要】
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乳腺癌是位于肺癌之后的第二大危害人类身体健康的癌症,尤其给女性的生命造成了极大的威胁,同时也给社会造成了极大的经济负担。因此,研究乳腺癌的发病进程和发病机理有着极
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乳腺癌是位于肺癌之后的第二大危害人类身体健康的癌症,尤其给女性的生命造成了极大的威胁,同时也给社会造成了极大的经济负担。因此,研究乳腺癌的发病进程和发病机理有着极大的意义。肿瘤的研究已经持续了很多年,关于乳腺癌的组学相关研究包括基因组,转录组,表观遗传组,代谢组,我们选用的是基于高分辨质谱的蛋白质组学为切入点,因为蛋白质是生命活动的承担者,和疾病的发生有着最直接的联系。定量蛋白质组学的研究手段种类繁多,从数据采集方法划分,包括 DDA(Data Dependent Acquisition),DIA(Data Independent Acquisition),PRM(Parallel Reaction Monitoring);从样品标记方法划分,包括SILAC,SILAM,TMT,iTRAQ等。DIA是一种非标记的蛋白质定量方法,可用于多个样品的相对定量,与TMT和ITRAQ这两种标记方法相对比,节约成本。本次实验采用的是MC10AT细胞模型,这个细胞模型模拟了乳腺癌的发病过程。我们首先使用DIA方法进行了细胞模型的蛋白质组学研究,鉴定到3000个种蛋白,通过生物信息分析和文献查阅,挑选了 19个蛋白使用PRM进行验证。通过PRM数据分析,鉴定到其中13个蛋白在两个成瘤细胞株中存在着显著性差异。同时,我们还采用了 QPCR方法从mRNA水平对靶蛋白进行研究。为了进一步研究靶蛋白的功能,我们挑选了两种蛋白(ACLY—ATP柠檬酸裂解酶,FASN—脂肪酸合成酶),进行质粒构建,在MCF1OCAla细胞株对靶基因进行敲低。确认了敲低效率之后,通过体外细胞迁移实验,确认靶基因对肿瘤细胞的迁移性影响。
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