农业是国民经济的基础产业。中国作为一个农业人口占大多数的发展中国家，重视农业的基础地位、解决好“三农”问题，始终是党和政府长期追求的目标。增加农民收入是“三农”问题的核心，是关系着农民切身利益的问题，而农业投资是影响农民收入的重要因素之一。2012年2月1日中央一号文件《关于加快推进农业科技创新持续增强农产品供给保障能力的若干意见》正式公布，这已经是中央一号文件连续第九年聚焦“三农”问题，期间出台了一系列强农惠农富农政策，大幅度增加对农业的投入。政府农业投资效率一直是公共投资领域最为关注的一个问题，而从政府农业投资所投向的各项结构变量对农业GDP和对农民人均纯收入的影响程度角度研究的有关政府农业投资结构效率的相关文献一直比较少。鉴于“三农”问题的重要程度，我国政府要转变对农业的投资观，在增大农业投资力度的同时，更要调整对农业投资的结构，发挥农业投资的效用，促进农民增产增收，推动农业、农村经济发展。因此，从理论的高度、从定量的角度研究政府农业投资结构效率问题是必要的。　　本文从理论和实践两个方面来研究我国政府农业投资结构效率，主要采用的研究方法是多元统计和计量经济学方法（主要运用VAR模型与ECM模型），分析不同投向的农业投资对农业GDP和农民人均纯收入的影响程度，从数量关系中分析并得出具有较普遍意义的结论。　　全文共分5章，其中:　　第一章，引言。主要叙述开展这项研究的背景和意义，在综合评述国内外相关文献研究的现状的基础上，提出本研究的基本思路和框架结构，说明准备采取的研究方法和技术路线，以及本论文主要要做的工作。　　第二章，本项研究的理论依据。本章分析了开展政府农业投资及其结构效率研究的理论基础，界定了政府农业投资的涵义与范围，介绍了古典自由主义、市场失灵和国家干预经济理论、西奥多·舒尔茨的农业经济理论、帕累托效率理论与政府农业投资结构效率理论。政府农业投资结构效率，其研究关键是政府农业投资结构是否合理以及在多大程度上合理的问题，主要是探究如何在众多的农业资金需求之间将有限的总投资资源或者政府的投资能力进行平衡分配。政府农业投资结构效率应该是建立在帕累托基础上的组合效率。　　第三章，从政府农业投资的不同投向角度分析投资结构效率。这一章是本文的核心章节，运用计量经济学中的VAR与ECM模型，分别对政府农业投资的五个结构变量对农业增加值的作用程度和政府农业投资的三个结构变量对农民人均纯收入的弹性进行实证研究，分析了不同投向的政府农业投资对农业GDP和农民人均纯收入的影响程度。五个变量指标对农业GDP作用程度的先后顺序依次是:支农支出、农业科技三项费用、农业基本建设支出、扶贫资金、农业综合开发。从变量之间的弹性来看，政府农业投资中，农业科技三项费用对于农民人均纯收入的弹性最大，其次是基本建设支出，支农支出的弹性最小。最后本章得出了农业科技三项费用的作用逐渐凸显的结论，而农业投资结构不合理是影响投资效率的重要原因。　　第四章，中央政府“三农”投资结构效率分析。研究中央政府“三农”投资结构这一问题有助于了解当前我国政府农业投资的走势和重点投向，进一步调整和优化政府农业投资结构，提高政府农业投资效率。因此，本章对中央政府“三农”投资结构进行分析，重点以1996-2012年数据为研究对象。分析结果表明，“三农”投资的各项支出绝对数额都持续增长，支农生产支出比重保持在40％左右，值得一提的是促进农村教育、卫生等社会事业发展支出绝对数额及比重都是显著增加的，反映了中央政府调整农业投资结构的转变过程。　　第五章，主要结论和政策启示。本章在总结全文理论研究和实证研究结论的基础上，得出了农业科技三项费用作用凸显、政府农业投资结构有待优化、“三农”投资结构不断优化的结论，提出了关于合理界定政府农业投资范围、继续加大农业投资力度、稳定农业基本建设支出规模、增加农业科技和农村人力资本投资、压缩事业费支出等具体的政策建议。