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作为微生物中重要类群之一的放线菌,它可以产生许多具有抗菌活性的次级代谢产物。这些天然的活性产物在医疗行业、化工行业、农业以及环境污染治理方面都有广泛的应用。所以,从放线菌中发现新型抗生素成为了当今研究的热点。为了避免从已有的放线菌中的重复分离化合物,本研究选取了不同于传统的分离放线菌的分离源:植物和植物根际土壤,以期发现放线菌新种进而发现新型化合物。本研究所选取的分离源是万寿菊(Tagetes erecta L.)植株和植株根际土壤。经过多次反复分离,从万寿菊植株和植株根际土壤共分离得到了37株放线菌。并且对分离出来的37株放线菌分别对2种细菌和10中真菌进行了活性测试,结果显示:有5株放线菌的发酵液浸提物对两种细菌的抑制直径在15mm以上;有9株菌对2种以上真菌表现出较好抑制的作用,其中有2株放线菌的菌落对3种真菌的抑菌直径在20mm以上,只有1株放线菌对4种真菌的抑菌直径在20mm以上。对从万寿菊植株和根际分离出的37株放线菌的菌落形态、显微镜制片观察及活性测试的结果分析后,对NEAU-TWSJ13和NEAU-YJC4进行16S r DNA的基因测序。通过网站的比对和构建系统发育分析,NEAU-TWSJ13属于链孢囊菌属(Streptosporangium),NEAUYJC4属于小链孢菌属(Catellatospora)。其中,与NEAU-TWSJ13最相似的菌株是Streptosporangium fragile DSM 43847T,16S r RNA相似性是98.6%;与NEAU-YJC4 16S r RNA最相似的菌株是Catellatospora bangladeshensis JCM 12949T(98.7%)。通过与相似菌株进行形态特征比较、化学分类特征比较和分子分类特征比较,结果显示NEAU-TWSJ13和NEAU-YJC4在和其属菌的基本特征一致的情况下,还可以区别于属内的其他菌株。由此说明,NEAU-TWSJ13是链孢囊菌属的新种,NEAU-YJC4是小链孢菌属的新种,分别命名为Streptosporangium subfuscum和Catellatospora tagetis,并分别将它们送到中国、德国、日本菌种保藏中心进行保藏,保藏号分别为NEAU-TWSJ13(CGMCC 4.7146和DSM 46724)和NEAU-YJC4(CGMCC 4.7176和JCM 30053)。由此可见,把植物和植株根际土壤作为样本进行分离提高了发现新种的可能性,同时也为分离出新型活性物质奠定了基础。