拟南芥窄叶抗病突变体27.2基因的图位克隆与功能研究

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植物抗病信号传导一直是分子植物病理学研究的热点,植物防御网络是一个非常精密复杂的系统,现在总结出植物中存在两大主要的抗病信号通路,分别是水杨酸和茉莉酸介导的信号途径。这两种激素是植物受到病原菌感染后产生的非常重要的信号分子,它们能够分别诱导产生系统获得性抗性(SAR)和诱导系统抗性(ISR)。这两条信号途径中的一些重要元件已经得以鉴定,但是其中仍有很多机制不甚明晰,还存在许多元件等待挖掘和鉴定。  突变体筛选是经典的也是最常用的鉴定信号途径中新元件的方法。本研究从EMS化学诱变拟南芥野生型Col-0突变体库中筛选获得了一个突变体,命名为27.2。27.2具有叶片窄小而卷曲,且叶表面有坏死斑的表型。对突变体的抗性分析发现,该突变体叶片中H2O2和超氧化物的含量升高,可组成型表达抗病蛋白基因PR1,并且对拟南芥病原细菌丁香假单胞杆菌(Pst DC3000)表现出抗性增强。利用图位克隆的方法从5000个单株的F2群体中克隆了该基因,序列比对发现27.2编码一个硬脂酰-ACP去饱和酶(AT2G43710)。有趣的是,我们在基因的编码区同时发现了两个G→A的点突变。功能互补实验验证了导入野生型基因片段可完全恢复上述突变表型。AT2G43710编码402个氨基酸,生化功能是催化硬脂酸(18∶0)向油酸(18∶1)的转化过程,它是植物合成不饱和脂肪酸的关键基因。AT2G43710此前已被发现与植物的抗病性有关,前人在筛选npr1的回复突变的突变体库中鉴定并克隆到了这个基因,并被命名为SSI2(suppressor ofSA insensitive2)。AT2 G43710基因的146位氨基酸的突变可造成SSI蛋白的酶活性降低,导致对Pst抗病性提高。但本研究发现的27.2突变位点以及表型与已经报道的ssi2不完全一致,因此我们将27.2突变体重新命名为ssi2-1。  通过比较ssi2-1和ssi2,ssi2-2(T-DNA突变体)之间抗病性和酶活性等生理生化的指标,我们发现ssi2-1无论是在抗病性还是在生长发育上的表型都是介于野生型和ssi2与T-DNA突变体之间。例如ssi2-1、ssi2和ssi2-2突变体中PR1基因相对于野生型均有提高,上调倍数ssi2-1为28.9倍,而ssi2,ssi2-2突变体中达到835.4倍和244.9倍。在酶活性方面ssi2-1也符合这一特征,ssi2-1,ssi2突变体的叶片中油酸(18∶1)的含量相比野生型均有下降,ssi2的含量约为野生型含量的1%,而ssi2-1中可以达到野生型的30%。这些结论都说明ssi2-1是SSI2基因的一个弱突变体。  利用RNA-seq技术我们对Col-0,ssi2-1,ssi2,ssi2-2进行了分析。发现在SSI2的三个突变体中,有747个基因被共同上调。这些基因包括一些已经鉴定的与植物抗病反应相关的基因,如PR1基因,钙结合蛋白(calcium-binding protein),MKK4基因(mitogen-aetivated protein kinase kinase4)等等。另有892个基因被共同下调,这其中包括大量与光合作用,碳固定有关的基因,这也符合SSI2的三个突变体均表现出植株矮小这一特征。同时,RNA-seq数据进一步支持了ssi2-1是SSI2基因的一个弱突变体的结论。  后续研究发现ssi2-1中的点突变不影响SSI2蛋白自身互作,从而排除了ssi2-1通过影响SSI2二聚体的形成进而影响其酶活性的假设。利用酵母双杂交技术筛选拟南芥酵母双杂交文库得到了8个可能的SSI2互作蛋白,并对其中一个基因进行了深入研究。该基因编码β型碳酸酐酶(Carbonic Anhydrase,β-CA1),此前被发现参与植物抗病反应和SA信号转导。CA1与SSI2之间的互作分别通过酵母双杂交和双分子荧光互补实验得到了证实。我们发现SSI2基因的三个突变体中CA1基因的表达都是被抑制的,说明SSI2可能参与调控CA1基因的表达。通过检测植物叶片总碳酸酐酶活性显示ssi2-1中CA1酶活性降低,而Col-0和ssi2中并没有这一现象,且ssi2-1突变不影响与CA1的互作,暗示SSI2能够直接通过蛋白互作影响CA1酶活。同时,我们发现cal突变体中的SSI2酶活性是上升的,ssi2-1 cal双突变体表现出对病原菌Pst DC3000增强的感病性,与cal单突变体表型相一致,而叶片窄小的表型则与ssi2-1类似。由此,我们认为CA1与SSI2之间可能通过直接的蛋白互作相互影响酶活性而传递抗病的信号。CA1是ssi2-1抗病过程中所必需的,在这一过程中,SSI2可以正向调控CA1,而CA1负反馈SSI2,它们共同完成SSI2对植物感病性(或CA1对植物抗病性)的信号传导。
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