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红曲菌是一种丝状真菌，能够产生红曲色素、莫纳可林、麦角固醇等多种具有生物活性的代谢产物，具有很高的商业价值。但是由于红曲菌产桔霉素问题的存在，使红曲产品的安全性受到质疑。
本文采用基因敲除技术，构建了一株pksCT因缺失的基因工程红曲菌，为研究构建工业化菌株提供参考：利用蛋白质组学方法对一株红色红曲菌及其pksCT基因缺失株的蛋白质组进行了初步研究。主要内容如下：
1采用基因敲除了构建红曲菌M22的pksCT基因缺失株，利用潮霉素抗性筛选和基因组DNA的PCR验证，获得M22k红曲菌基因缺失株。通过HPLC检测原始菌株和缺失株液态培养物中的桔霉素含量，证实缺失株产桔霉素能力下降了73.6％～94.0％。
2利用TCA-丙酮法提取红色红曲菌总蛋白质，通过比较和分析培养基种类、蛋白质裂解液组成、水化上样条件等因素对双向电泳结果的影响，建立了红曲菌蛋白质组双向电泳体系。用YES培养基培养菌丝体6d，TCA-丙酮法提取粽蛋白质，蛋白质裂解液B(8M尿素，2M硫脲，4％CHAPS)溶解粗蛋白提取物，主动水化上样，双向电泳图谱中蛋白质样点数217，匹配率75％。
3采用双向电泳技术分析一株红曲菌及其pksCT基因缺失株的蛋白质表达差异，对pksCT基因缺失影响红曲菌蛋白质表达进行了初步研究。