玉米胚乳突变dek基因的精细定位

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玉米不仅是主要的粮食来源,而且也是重要的饲料和工业材料,对于国民经济发展具有十分重要的作用。随着人口增加和耕地减少,玉米的地位越来越重要。百粒重是玉米产量构成的三要素之一,而籽粒性状又对百粒重的高低起着决定性的作用。胚和胚乳是籽粒的两个主要组成部分,其中胚乳约占玉米籽粒总重量的70-80%,因此发现并克隆控制玉米籽粒发育尤其是胚乳发育过程中的关键基因,对剖析籽粒发育和形成遗传机理以及提高玉米产量具有重要意义。本研究以课题组在大田育种中发现的一个玉米胚乳自然突变材料为研究对象,突变体的表现为籽粒干瘪,灌浆不充分,穗部的正常籽粒与突变籽粒呈现3:1的分离比,由1对隐性基因控制,表现为孟德尔遗传。利用609个单株的分离群体,将该胚乳突变基因dek定位于玉米第2号染色体2.03bin上的引物chr2.03-20-1和bnlg1064之间。利用与目标基因紧密连锁的分子标记chr2.03-20-1和bnlg1064对1 1000粒分离穗上的正常籽粒的胚乳DNA进行标记检测,筛选出在目标基因两侧分子标记不一致的交换单株520株。通过自交对交换单株及其后代的籽粒表型与田间植株性状进行鉴定,同时借助B73基因组序列,在候选基因区域内开发新的分子标记252对,筛选到多态性标记9对,最终将目标基因定位于标记chr2.03-174和chr2.03-228之间,物理距离为950kb。利用生物信息学的方法对该区段进行了候选基因的预测,共得到有GO注释的基因15个。
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