我国绵羊痒螨(兔亚种)线粒体COⅠ、COⅡ和核糖体ITS序列的遗传多样性分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huoxingtan22
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
兔痒螨病是由绵羊痒螨(兔亚种)(Psoroptes ovis var.cuniculi)所引起的一种高度接触性的慢性皮肤疾病,该病是兔的常见外寄生虫病之一,我国报道的兔感染率为11.11%~70.00%。兔感染痒螨病后,以瘙痒和外耳道结痂为主要临床症状,还可引起其增重率、饲料转化率和免疫功能降低,甚至死亡,给养兔业造成巨大的经济损失。我国家兔养殖区域分布较广,各区域具有较大的气候环境和地理地形差异,不同地域来源的兔源痒螨是否会出现遗传变异尚不可知。因此,本研究对我国暖温带和亚热带的西南、华中、华北、华东和西北地区的獭兔和肉兔绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多态性进行研究和分析。主要研究结果如下:1.基于线粒体基因COⅠ和COⅡ基因全序列分析绵羊痒螨的遗传多样性为探讨绵羊痒螨(兔亚种)是否会受兔种类、温度带和地域来源的不同而出现遗传变异,本研究采用PCR技术首次对我国西南、华中、华北、华东和西北5大地区8个省14个采样点的128个绵羊痒螨(兔亚种)虫株单个虫体的线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)和细胞色素氧化酶Ⅱ(COⅡ)基因全序列进行扩增、测序,并利用单基因和COⅠ+COⅡ联合基因分析我国绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传变异。测序共得到119条COⅠ(1,548bp)和126条COⅡ(769bp)序列,经拼接得到117条COⅠ+COⅡ序列(2,317bp)。基于单基因和联合基因分析发现,我国绵羊痒螨(兔亚种)种群具有较高的单倍型多样性(Hd:COⅠ:0.99174,COⅡ:0.91517,COⅠ+COⅡ:0.99853)和核苷酸多样性(π:COⅠ:0.01004,COⅡ:0.00884,COⅠ+COⅡ:0.0099),遗传距离分析表明地理距离的远近与各种群间的遗传距离大小无关。AMOVA分析发现我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异主要发生在种群内部(COⅠ:87.63%、COⅡ:93.97%:、COⅠ+COⅡ:88.38%);遗传分化分析结果显示各地理种群间存在一定的遗传分化但分化不明显(Fst值:COⅠ:0.1237;COⅡ:0.0603;COⅠ+COⅡ:0.1162);中性检验值(Tajima’sD 和Fu’sFs)均呈不显著的负数,且错配分布图呈现出多峰现象,表明我国绵羊痒螨(兔亚种)种群处于一个比较稳定的水平;单倍型网络图和ML树显示我国兔痒螨的聚类与兔种类、温度带和地理来源无关。因此,认为我国5大地区的兔痒螨虫株呈现较高的遗传多样性,具有一定的遗传分化,但未形成以兔种类、温度带和地理分布为格局的遗传结构,长期处一个比较稳定的水平。2.基于核糖体转录间隔区)序列对绵羊痒靖(兔亚种)种群遗传多样性的研究(ITS为了进一步了解我国绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传变异情况,本研究进一步对我国5大地区8个省14个采样点的128个绵羊痒螨(兔亚种)样品的ITS序列(ITS1、5.8S全序列和ITS2部分序列)进行PCR扩增、测序和分析。结果得到128条ITS序列(800bp~804bp),序列间的同源性为97.36%~100.00%;128条序列共有166个变异位点和92个单倍型;我国整体种群的Hd和π分别为0.98364和0.02619;地理距离的远近与各种群间的遗传距离无关;我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异主要发生在种群内部(97.23%),整体种群内的遗传分化不明显(Fst=0.0277),种群间存在频繁的基因交流(Nm=8.7753);我国整体种群的中性检验值(Tajima’sD=-0.19708,Fu’sFs=-4.46245)为差异不显著的负值,且呈多峰的错配分布现象;单倍型网络图和ML树显示我国兔源痒螨的聚类与兔种类、温度带和地理来源无关,且与其他宿主来源的痒螨聚类相互交错。综上所述,基于线粒体基因和核糖体基因综合分析,我国绵羊痒螨(兔亚种)具有较高的遗传多样性,各种群间基因交流较为频繁,长时间内未发生过种群扩张事件,处于一个比较稳定的水平,并且未形成以兔种类、温度带和地理分布为格局的遗传结构。
其他文献
中国历史文化源远流长,五千年来,在勤劳勇敢的中华儿女的共同努力下,形成了具有鲜明特征的中华文化。其中,中华民族优秀的传统文化在历史发展中渐渐沉淀,不仅对个人的成才和中华民族的发展起了不可替代的作用,而且对当代甚至未来中国社会的发展起着重要作用。随着网络科技的迅速发展和共享时代的到来,部分大学生在面对新媒体时代的多元文化思潮时出现了偏差,一定程度上忽视了优秀传统文化对人和社会发展的作用,出现了价值判
“长治”工程长期按“国家补助+地方匹配+农民自筹”的模式运行,湖北秭归在这种模式下较好地实施了“长治”工程,为当地经济发展起到强大的推动作用,但在农村取消农业税和“两工
“微时代”背景下的高中思想政治教育既有新机遇,但同时又受到严峻的挑战。本文从“微时代”的相关界定及特征入手,考察高中思想政治教育的新载体,以“微时代”所展现的移动
信息学奥赛中所包含的内容很多,很多学校在进行信息学奥赛课堂教学的时候,所采用的传统方法比较被动,使得学生的学习过程十分吃力,教师虽然做出了较多的努力,但是无法获得预
问题解决是培养和发展学生创新能力的重要方式,是科学家对未知领域进行探索的重要环节。新课程改革的目的是培养创新精神和实践能力,促进每个学生身心健康发展,培养良好品德,
近些年,我国经济实力不断提高,对基础设施的投入力度的不断加大,我国的大型、特大型工程日益增多,大体积混凝土工程也越来越多。本文对大体积混凝土的裂缝控制技术进行阐述。
依据安全、优质、经济运行原则,规范小区供配电建设,提升供配电设备质量,确保供电设施稳定,成为影响小区居民生活的重要因素。本文在分析当前住宅小区供配电设施的现状及存在
文章以病理学“炎症”章节为例,采取慕课教学模式。通过对照实验和问卷调查的方法,分析学习效果,发现学生的学习兴趣和学习能力均有所提高。
目的了解我国采供血机构人力资源的现状及趋势性变化。方法设计《全国采供血机构人员组成情况调查表》(《调查表》),调查项目包括人员编制、卫生技术人员、学历、职称等情况