城镇化是我国建设社会主义新农村的必然路径,在这一过程中必然伴随着国家对农村土地的征收、征用。农村基层组织人员在协助政府发放征地补偿款过程中,增加了与大额征地款项的接触机会以及将其据为己有而触犯法律的可能。尽管我国《刑法》和相关的立法解释对农村基层组织人员的此种犯罪行为予以了一定规制,但是由于法律规定的原则性和不清晰、不具体,造成了司法实践中法院对基层组织人员侵占征地补偿款行为定性的困难,以及公安机关和检察机关侦查时的管辖冲突。这些问题的存在不仅严重影响了我国法律的严肃性和法院判决的公信力,而且容易激化农村村民与基层组织人员的矛盾、破坏群干关系、影响当前农村的社会稳定,最终有碍于社会主义新农村建设的进程。文章首先以山东省德州市司法实践中的案例和审判现状为视角,通过以小见大的方式分析、总结农村基层组织人员侵占征地补偿款的犯罪行为的特点；然后基于现行的相关立法及司法解释分析我国对基层组织人员侵占征地补偿款行为的法律规制现状；进而从犯罪构成四要件的角度对基层组织人员侵占征地补偿款的行为进行理论上的刑事定性,具体包括农村基层组织及其人员的外延、农村征地补偿款的范围、基层组织人员管理行为的行政性认定和基层组织人员侵占征地补偿款时的主观罪过四个部分。紧接着,从实践的角度分析我国目前惩治农村基层组织人员侵占征地补偿款行为在司法实践中的难题及解决方案；最后笔者基于前文的理论分析个实践难题从犯罪学和刑法学的角度,全面分析农村基层组织人员侵占征地补偿款犯罪行为产生的原因及其相应的解决方案。