丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)是中国传统大宗类药材之一,野生群体在我国中东部广泛分布,为唇形科鼠尾草属多年生草本植物。由于在治疗心脑血管疾病上具有显著疗效,导致近年来丹参药材的需求量持续增加。然而在如今,野生丹参由于多种原因,数量正在急剧下降,远远不能满足市场需求,与此同时,各产地栽培丹参质量参差不齐,品质退化严重,各种丹参替代品导致市场鱼龙混杂。因此,搞清丹参遗传背景,保护野生丹参种质资源显得尤为重要。近年来关于丹参种质资源遗传多样性研究虽然陆续有所报道,但大多数仅限于栽培群体或者少量野生群体,尤其是对全国范围内野生丹参种质资源尚未研究。基于此,本研究以全国范围内野生丹参群体为研究对象,利用SSR分子标记和生物学性状等指标对丹参资源进行系统多样性研究与评价,为丹参种质资源保存、分类鉴定、合理应用奠定基础。研究结果如下:1.野生丹参种质资源库的构建。已完成对全国15个省份野生丹参样品收集,完全覆盖丹参自然分布区域。共计获得1432份丹参分子材料,获得234份标本,获得358份活体材料。2.野生丹参群体遗传多样性研究。基于转录组数据大规模开发丹参微卫星标记中,共计获得16895个SSR位点,并成功开发出40对SSR引物(PIC>0.3)。基于SSR分子标记野生丹参种质资源遗传谱系分析表明,所有野生丹参种质资源分为两大遗传谱系,一类为南丹参,另一类为丹参。群体结构分析结果与谱系分析结果基本一致。3.野生丹参群体形态多样性研究。选用13个质量性状和9个数量性状对84份丹参种质资源的形态多样性进行评价。主成分分析显示,所有选择性状均参与有效主成分的构成。变异系数分析显示,质量性状变异系数在0.257-0.579之间;数量性状变异系数在0.145-0.421之间。聚类分析结果显示,利用所选质量性状可将南丹参和丹参群体完全分开,其中丹参和南丹参内部大多数群体可分开。利用所选数量性状仅可以将南丹参和丹参大致分开。因此,在鉴定各地丹参和南丹参优先选择质量性状,同时把数量性状作为补充。