2013年1月1日修订后的我国《刑事诉讼法》正式施行。本次修订的亮点之一是增设了未成年人犯罪特别程序,充分尊重和保障了涉罪未成年人的人权,赋予了涉罪未成年人特殊的权利,体现了极其重要的意义。未成年人犯罪特别程序包含社会调查制度、附条件不起诉制度、犯罪记录封存制度等多种特殊制度,特殊制度的确立是对涉罪未成年人的关爱,保护了涉罪未成年人的合法权益,同时有效的矫正涉罪未成年人,有利于他们改过自新、重返社会、顺利健康发展。但是,司法实践中公检法三机关在贯彻执行过程中,不同程度的遇到一些问题。例如法律规定不明确、具体执行操作不统一、执行过程中有冲突等问题。文章仅以基层检察机关办理未成年人犯罪案件为依托,选取特殊制度中的社会调查制度、附条件不起诉、犯罪记录封存三项制度,对其从立法层面、司法实践层面的问题进行分析,针对未成年人犯罪的这三种特殊制度立法层面障碍和司法障碍进行分析论证,以便司法机关在执行过程中更好的运用、执行其特殊性。文章将三种特殊制度分开研究,从立法完善、主体范围、程序启动、监督考察等方面出发,提出针对性和操作性的建议,进一步加强和完善社会调查制度、附条件不起诉制度、犯罪记录封存制度。