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目的:本研究旨在通过全转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-se q)在全基因表达谱范围内寻找所有和TB-IRIS(Tuberculosis-associated I mmune Reconstitution Inflammatory Syndrome,TB-IRIS)发生相关宿主因子或标志物,探寻其预警指标,协助疾病早期诊断,为有效降低TB-I RIS发病率和病死率、提高患者生活质量提供帮助。方法:纳入4例单纯艾滋病(acquired immune deficiency syndrome,AIDS)患者(H组),6例AIDS合并肺结核(Tuberculosis,TB)未发生IRIS患者(HT组),6例AIDS合并TB发生IRIS患者(HTI组),分别收集各组抗逆转录病毒治疗前(Antiretroviral Therapy,ART)和ART 2周时外周血,分离外周血单个核细胞(Peripheral Blood Mononuclear Cell,PBMC),构建c DNA文库,采用RNA-seq技术,分别检测各组患者两个时间点的全转录组表达水平,通过分析比较筛选出各组内ART前后以及HTI组相对于HT组ART前后显著差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),然后应用生物信息学方法进行富集分析(Target Mine通路富集分析)进一步筛选出具有生物学意义的DEGs及相关信号通路。应用实时荧光定量PCR(q-PCR)对测序结果进行验证,最终确定与TB-IRIS发生可能相关的预警基因。结果:(1)ART前HTI组CD4+T细胞水平显著低于H及HT组(p=0.010),HI V-RNA血浆病毒载量水平显著高于H及HT组(p=0.023)。ART后HTI组CD4+T细胞数目一定程度恢复且HIV病毒载量显著减少(平均减少到原来的1%),但HIV-RNA病毒载量水平仍显著高于H及HT组。(2)ART前HTI组与HT组共392个DEGs(197个上调,195个下调)(p<0.01,FDR<0.05),其中38个显著富集于通用转录途径(Generic T ranscription Pathway)(P=1.11e-6)。(3)各组内ART后相对ART前,HT组共有36个DEGs(28个上调,8个下调),HTI组共有74个DEGs(50个上调,24个下调),H组未发现DEGs。通路分析显示HTI组74个DEGs显著富集于干扰素α/β信号通路(p=1.35e-7)及细胞因子相关通路。(4)ART后HTI组相对于HT组共88个DEGs(81个上调,7个下调)。通路富集分析显示这些基因显著富集于细胞周期相关通路。结论:(1)ART前低CD4+T细胞数目和高HIV-RNA病毒载量可能与TB-IRI S的发生相关。(2)TB-IRIS的发生可能与干扰素α/β信号通路、细胞因子相关通路、细胞周期通路有关。(3)初步明确了TB-IRIS显著差异基因表达谱,且RNA-seq技术可以作为预测TB-IRIS的方法。