拟果蝇(D.simulans)Cu/Zn-SOD基因反转录序列的发现及初步分析

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反转录转座(retrotransposition)是通过RNA介导的一种转座方式,也是基因组产生新基因的主要方式之一。近年来,在脊椎动物和无脊椎动物中,人们发现数目众多的基因进行了反转录转座,并对这种产生新基因的机制有了较深入的了解。 发生反转录转座的基因一般称作亲本基因 (parental gene),发生反转录转座后,亲本基因本身并不发生变化,而是在基因组的其它位置增加一段亲本基因的cDNA序列,这种序列被称为反转录序列 (retrosequence)。一般情况下,有功能的反转录序列称为反转录基因(retrogene),没有功能的就称为反转录假基因(retropseudogene)。 Cu/Zn-SOD 基因是一个单拷贝基因,位于果蝇的3号染色体上,它编码的超氧化物歧化酶(Cu/Zn superoxide dismutase)有抗氧自由基的功效,能抵抗衰老。在分子系统学研究中,该基因是一个合适的分子标记。在本实验中,首先通过PCR方法研究了黑腹果蝇种组 (Drosophila melanogaster species group) 部分物种的Cu/Zn-SOD基因,在研究中我们发现拟果蝇(D.simulans)的Cu/Zn-SOD基因发生了反转录转座。通过验证实验显示反转录产生的反转录序列存在于拟果蝇(D.simulans)的Y染色体上。另外,通过分子钟检验和分子系统学分析显示,该反转录序列进化速率较快,可能属于反转录假基因。
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