基于分子信息和数据挖掘技术的ⅡA期食管鳞状细胞癌预后研究

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目的:1.探讨ⅡA期食管鳞状细胞癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)的预后因素。 2.建立ⅡA期ESCC个体化预后预测的数学模型。 研究方法: 1.回顾性分析中山大学肿瘤防治中心1990年1月~2000年12月收治的422例ⅡA期ESCC患者的临床资料。 2.利用组织芯片技术和免疫组化染色方法检测中山大学肿瘤防治中心1997年1月~2004年12月收治的227例ⅡA期ESCC肿瘤组织中Bax、Bc—2、caspase—3、CD44v6、Ki67、Id-1、P27、c—myc、CyclinD1、COX—2、E—cadherin、EGFR、Rb、Fas、c—erbB—2、MMP—2、MMP—9、nm23、P16、P21、Ezrin、OPN、P53、P63、PCNA、PTEN、Survivin、galectin—3、TIMP-1、TIMP—2、β—Catenin和VEGF32种分子标记物的表达情况。 3.应用Kaplan—Meier法进行单因素生存分析,组间比较用log—rank检验,多因素生存分析采用Cox回归模型。 4.利用支持向量机(supportvectormachines,SVM)数据挖掘技术,建立ⅡA期ESCC个体化预后预测的数学模型。 结果: 1.Kaplan—Meier单因素生存分析显示肿瘤浸润深度、分化程度、Rb、P53、MMP—2、β—Catenin、CyclinD1和Fas的表达与ⅡA期ESCC预后有统计学意义。Cox多因素生存分析显示肿瘤浸润深度、分化程度、Rb和Fas是ⅡA期ESCC预后的独立影响因素。 2.基于SVM的ⅡA期食管癌预后预测模型包括25个变量:肿瘤位置、Bax、caspase—3、CD44v6、c—erbB2、COX—2,CyclinD1、E—cadherin、EGFR、Ezrin、Fas、galectin—3、ID-1、Ki67、nm23、P27、P53、P63、PCNA、PTEN、Rb、Survivin、TIMP-1、VEGF和β—Catenin。 3.该模型预测ⅡA期食管癌术后5年生存状态正确率为72.7%,敏感度为63.0%和特异度为96.0%。 结论: 1.肿瘤浸润深度、分化程度、Rb和Fas是ⅡA期ESCC预后的独立影响因素。 2.基于SVM的ⅡA期食管癌预后预测模型包括25个变量:肿瘤位置、Bax、caspase—3、CD44v6、c—erbB2、COX—2,CyclinD1、E—cadherin、EGFR、Ezrin、Fas、galectin—3、ID-1、Ki67、nm23、P27、P53、P63、PCNA、PTEN、Rb、Survivin、TIMP-1、VEGF和β—Catenin,该模型预测ⅡA期食管癌术后5年生存状态正确率为72.7%,敏感度为63.0%和特异度为96.0%。 3.利用支持向量机数据挖掘技术建立的数学模型可以较好的实现对ⅡA期ESCC患者的个体化预后预测。
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