国家重大投资项目是指由中央政府主导的、投资额特别巨大的建设项目。而项目又是一系列独特的、复杂的并相互关联的活动，是一个庞大的社会系统工程。审计监督是国家重大投资项目建设的重要环节，要搞好重大项目的建设，必须明确国家重大投资项目审计的独立性、强制性、二律性等特征，充分发挥审计监督的职能及作用，提高审计质量和工作水平。 目前国家重大投资项目审计与我国政治经济制度、治国方略相适应，对于加强重大投资项目建设，起到了一定的保证作用，但多是事后审计，因此存在着滋生腐败的漏洞。应该借鉴国外审计体制透明度高、独立性强的特点，完善我国重大投资项目的审计工作。一是积极开展绩效审计，变审计的事后审查为重大投资项目运作过程的调控；二是实现国家审计“双轨制”，即在人大和政府分别建立履行不同审计职责的审计组织，从而保证资金合理有效使用，使国家重大投资项目建设得以顺利实施。