公司治理是指保护投资者利益的机制，它包括一系列的制度安排。一个具备完善的公司治理机制金融市场，可以保证公司有充足的资金流入，而不完善公司治理机制将妨碍外部资金流入公司，影响着证券市场和国民经济的发展。资本结构与股权结构决定了投资者在公司治理中控制权与索取权的分配，是最根本的公司治理的机制。资本结构的选择确定了股东和债权人之间的利益关系，负债不仅可以带来避税的效应，还使得公司面临财务困境的风险，同时带来了股东和债权人之间利益的潜在冲突。我国上市公司的资本结构表现为资产负债率较非上市公司低、流动负债偏高以及股权融资偏好，本文的分析表明与之相对应的公司治理的结果是随着资产负债率的提高公司的经营业绩反而下降。我国上市公司的股权结构表现为国有股主导的高度集中模式。在股权高度集中公司中，大股东往往会利用控股的权力谋取私人利益，相关的案例研究都说明了这一问题，本文的分析却发现具有绝对控股股东的上市公司的平均经营业绩要高于股权分散的上市公司。另外，国有股对公司经营业绩的影响却表现出不同的特征。股权分置改革是我国证券市场的重要制度改革，它将会改变我国上市公司的治理水平，但是在股权分置改革的过程中同样存在公司治理问题，本文证明最优的股权分置改革方案必须能够将对价水平同股票价格的变化联系起来。公司治理是一系列完整的制度安排，提高公司治理水平并不仅仅依靠优化资本结构和股权结构，证券市场的制度建设非常重要，特别是完善相关的法律及提高执行的效率。