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TREM1基因为Ig超家族成员之一,在髓系细胞中表达。TREM1可以增强由细菌和真菌感染后中心粒细胞和单核细胞介导的炎症反应,并在刺激细胞释放促炎症趋化因子和细胞因子的同时上调细胞表面活化标志物的表达。 本研究旨在利用全基因组关联研究(GWAS)发掘TREM1基因的单核苷酸多态性(SNPs),并研究这些多态性与TREM1参与炎症性疾病的相关性,阐明TREM1基因在免疫系统抵抗炎症性疾病中的作用。本研究主要结果如下: 1、奶牛TREM1基因SNPs位点多态性与重要的生产性状,如免疫机能和产奶量等存在显著相关性。通过进一步分析发现这些SNPs参与生物体内多种生物学过程,包括调节分子结合和催化活性以及构成细胞内重要组分等。通过利用ConSurf网站资源对TREM1蛋白质中所有与SNPs位置对应的进化保守的氨基酸进行分析,预测这些nsSNPs的潜在功能。ConSurf分析还发现了其他一些具有重要功能的氨基酸位点以及受nsSNPs影响的蛋白质翻译后修饰位点的改变与TREM1功能的关联。TREM1在先天性免疫系统识别病原体,尤其是细菌感染过程中发挥着重要作用。 2、TREM1基因SNPs位点影响动物体对乳房炎的易感性。我们对364头荷斯坦奶牛中TREM1的基因两个SNP位点(rs109937179和rs208224995)进行了研究。研究发现,SNP(rs109937179)中GG基因型和SNP(rs20822499)5中CA基因型与奶牛对乳房炎的易感性显著相关。生物学信息学分析推测:位于TREM-1基因剪接区域的SNP(rs109937179)对基因剪接、3UTR区bta-miR-2329-3p结合位点的SNP(rs208224995)对TREM-1基因表达可能具有调控作用。 3、LPS能介导由TLR4和TREM1引起的炎性细胞因子的产生,从而在TLR介导的炎症性疾病发生过程中具有效应增强的作用。本研究发现,LPS处理能显著上调RAW264.7细胞内TREM1的水平;而在RNAi干扰细胞内TREM-1表达后,白藜芦醇处理能进一步下调TREM-1的表达,白藜芦醇对TREM1的表达具有负调控作用和降低RAW264.7细胞内TREM1表达水平。本研究还检测了TLR4、促炎细胞因子IL6和TNFα,以及抗炎症因子IL10基因的相对表达量。研究发现,在LPS处理后RAW264.7细胞内TLR4水平显著上升,同时在RNAi干扰TREM1和白藜芦醇处理的细胞内TLR4水平显著下降。这些结果显示TREM1在增强TLR4介导的炎症反应中具有重要作用,从而刺激细胞产生炎性细胞因子。