硫代嘧啶类化合物的激发态结构动力学研究

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核酸分子中除了嘧啶和嘌呤碱基外,还含有数十种修饰碱基,它们是嘌呤或嘧啶环上的某一位置被一些化学基团(如甲基、甲硫基等)修饰后的衍生物。硫代嘧啶类化合物是研究比较多的硫代衍生物,它在核酸中的含量虽然很少,但却有着独特的生物化学和物理性质。硫代嘧啶化合物常作为抗癌药物分子中的活性结构单元,对紫外光高度敏感,在紫外光315-400nm处有吸收,希望为药物结合光动力疗法治疗癌症的作用机理提供基础数据。本文采用共振拉曼光谱技术研究了2-硫代胸腺嘧啶(5M2TU),2-硫代脲嘧啶(2TU),4-硫代脲嘧啶(4TU)在Franck-Condon区域的短时动力学特征,结合密度泛函理论计算方法讨论了5M2TU,2TU,4TU在微观光化学反应动力学上的调控因素,并取得了一些有意义的研究成果。(1)测得了5M2TU在水、甲醇和乙腈中的紫外光吸收光谱,5M2TU在水中和甲醇溶剂中的紫外吸收是类似的,都有两个吸收带,但与非质子溶剂乙腈中的吸收是有区别的,在其中出现三个吸收带。5M2TU在水和甲醇中的最大吸收为274.9和215nm,在乙腈中的最大吸收位于290.0,273.9和214nm。采用CPCM/H2O溶剂模型在B3LYP/6-311++G(d,p)计算水平上对5M2TU-nH2O(n=1,2)的结构进行了结构优化,并获得了它们的计算振动频率。随着氢键个数的增加,C=O振动频率减小。在266,273.9,282.4和299.1nm激发波长下,获取了5M2TU在不同溶剂中的共振拉曼光谱,结合密度泛函理论计算和FT-IR,FT-Rama实验,进行了光谱指认和激发态动力学分析。分析结果表明5M2TU电子吸收的跃迁主体是π→π*,它在水中的Franck-Condon区域短时动力学具有多维性,主要沿着C5=C6伸缩振动(υ7,1645cm-1),N1-H7/N3-H9的面内弯曲振动(υ8,1575cm-1),CH3的伞式振动(υ11,1362cm-1),C5-CH3伸缩振动+C6-H15的弯曲振动+环的伸缩振动(υ14,1225cm-1),C2=S8伸缩振动+N1C6C5对称伸缩振动(υ21,691cm-1)这五个简谐振动模展开。与胸腺嘧啶相类似,5M2TU在乙腈中的短时动力学特征与在水中的情况有所改变。5M2TU在乙腈溶剂中的共振拉曼光谱在1695cm-1附近出现了一个谱峰,这一谱峰也被指认为与C=O的伸缩振动相关。(2)测得了2TU在水、甲醇和乙腈中的紫外光吸收光谱,其谱图与5M2TU相似,在水和甲醇溶剂中的最大吸收是273和213nm,而乙腈中则位于291,268和211nm。同样地,在266,273.9,282.4和299.1nm激发波长下,获取了2-硫脲嘧啶在三种不同溶剂中的共振拉曼光谱,结合密度泛函理论计算和实验光谱,对它进行了光谱指认以及激发态动力学分析。C5=C6的伸缩振动+N1H8的面内弯曲振动(υ6,1623cm-1),N3H10/N1H8+C5H12/C6H7的面内弯曲振动(υ8,1433cm-1),C5H12/C6H7/N1H8的面内弯曲振动(υ11,1223cm-1),环的变形振动(υ17,718cm-1)四个振动模的基频和合频占据了共振拉曼光谱强度的主体部分。(3)采用两种不同的理论计算方法得到了4TU四种可能的异构体的能量,通过比较确定酮式-硫酮式结构体4TU1是稳定存在的。同时测得了其电子吸收光谱,结果表明4TU在水,甲醇和乙腈溶剂中都有两个吸收带(A-带和B-带),由于硫原子的取代,吸收光谱较尿嘧啶发生了红移,最大吸收波长为329nm(A-带)和256nm(B-带)。获得不同激发波长下的共振拉曼光谱,结合密度泛函理论方法研究了4TU的电子激发和Franck-Condon区域结构动力学。研究发现,4TU的共振拉曼光谱中C2=O8的伸缩振动υ5,C5=C6的伸缩振动υ6,N3H9/C6H12/C5H11面内弯曲振动υ10,C=S伸缩振动+N3H9面内弯曲振动υ11,C5H11/C6H12的面外弯曲振动υ23的基频、倍频和组合频占据了拉曼强度的绝大部分。
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