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目的:对用于HIV-1新近感染检测的BED-CEIA方法的实验性能进行评价;应用BED-CEIA方法在德宏州和重庆市的HIV-1感染者中进行检测,估算高危人群的HIV-1发病率;对德宏州和重庆市检出的新近感染者进行基因型耐药检测和亚型的分析,研究上述两地区新近感染者中HIV-1的分子流行病学情况及耐药的流行情况:探讨根据Trugene耐药报告中沉默突变个数初步区分样品亚型的可能性。
研究方法:
1、对在国家艾滋病参比实验室和重庆、德宏两个HIV确证实验室使用BED-CEIA方法进行新近感染检测的59、35和18块酶标板中质控品(NC、CAL、LPC和HPC)的OD和OD-n进行统计分析。对三个实验室初筛和确证实验结果的一致性进行比较,得出R<2>值。使用同一血清盘,将11位不同实验人员的实验结果与参比室实验员的实验结果进行比较,得出R<2>值。
2、对德宏、重庆、新疆和广东库存的1400份已知感染时间1年以上的HIV-1长期感染样品进行BED-CEIA检测,探讨该方法的假阳性率及其影响因素。
3、对德宏州2005年和2006年所有新诊断的HIV-1阳性样品进行BED-CEIA检测,估算不同人群的HIV-1发病率。
4、对重庆2006年MSM中检出的103份HIV-1阳性样品进行BED-CEIA检测并估算发病率。
5、使用Bayer Trugene HIV-1方法对德宏州和重庆市检出的部分新近感染样品进行基因型耐药检测,同时使用Trugene、HIVdb和Geno2pheno三种方法进行耐药性判定。
6、使用系统进化树、HIVseq和Geno2pheno三种方法进行亚型分析,并对三种方法的结果进行比较。
7、对样品的亚型与Trugene耐药报告中沉默突变的个数之间的关系进行探讨。
8、根据不同人群HIV-1感染率的不同,使用BED-CEIA发病率公式或者McDougal发病率计算校正公式估算HIV-1发病率。
9、实验数据采用SPSS 13.0进行统计分析。
结果:
1、三个实验室的OD和OD-n的CV值都比较低,OD-n的CV值均在12%以内:三个实验室的初筛和确认实验结果的一致性高,其R<2>均大于0.90;实验结果在12名不同操作者之间的可重复性强,R<2>=0.9777。
2、通过使用BED-CEIA检测1400份感染时间1年以上的长期感染样品,得到适合中国的发病率计算校正系数,即采用γ=0.9348(ε=0.0652)计算HIV-1发病率。
3、BED-CEIA检测接受ART的HIV-1长期感染样品和CD4≤50个/μl的未接受ART的HIV-1长期感染者样品时,错分率较高;在HIV-1长期感染者中,错分率与年龄、性别以及接受ART的时间无关,但在接受ART的感染者中,汉族高于少数民族(P<0.05)。
4、BED-CEIA估算的重庆市MSM的HIV-1发病率为7.27(95%CI,4.79-9.75)。
5、在德宏州2005年和2006年,BED-CEIA估算的IDU的HIV-1发病率分别为6.01(95%CI,3.78-8.23)和,8.74(95%CI,5.71-11.77)(P>0.05);暗娼为0:69(95~CI,0-2.04)和1.39(95%CI,0-3.31)(P>0.05);孕产妇为0.17(95%CI,0.08-0.27)和0.12(95%CI,0.06-0.19)(P>0.05)。2006年婚检人群的发病率为0.13(95%CI,0.02-0.24)。
6、德宏州(N=64)和重庆市(N=22)HIV-1新近感染者中的耐药流行率分别为6.25%和4.55%。三种耐药判定方法Trugene、HIVdb和Gen02pheno的结果存在差异。
7、重庆MSM新近感染者中以CRF07_BC为主,占77.27%(17/22);德宏州HIV-1新近感染者中的亚型有CRF07_BC/CRF08_BC、C、B和CRF01_AE,C/RF07_BC/CRF08_BC占65.63%(42164)。与HIVseq相比,Gen02pheno的分型正确率较高。
8、HIV-1新近感染者中CRF07_BC、CRFOS_BC、C以及CRF01_AE等非B亚型(N=75)样品的沉默突变的个数明显要比B亚型(N=13)多,分别为63.8(95%CI,37.7-89.9)和31.2(95%CI,7.2-55.1)。
结论:
1、BED-CEIA方法具有较高的检测性能,稳定性和重复性均比较高。
2、得到适合中国的BED-CEIA发病率计算公式校正系数。
3、应用BED-CEIA方法时,应尽可能排除接受ART的HIV-1长期感染样品和CD4+T淋巴细胞计数≤50个/μl的样品。
4、重庆市MSM的感染率和发病率均处在较高的水平,需继续加大监测力度和干预力度。
5、德宏州IDU人群的HIV-1感染率和发病率保持在一个较高的水平上,应继续监测该地区高危人群的发病率变化趋势。
6、我国HIV-1新近感染人群的耐药流行率仍处在较低的水平。
7、德宏州HIV-1新近感染人群以CRF07_BC/CRF08_BC/C亚型为主,重庆HIV-1新近感染人群以CRF07_BC重组亚型为主。
8、在中国使用Trugene进行耐药检测时,当样品的耐药报告中沉默突变的数目≥50时,可以初步确定该样品为非B亚型。