波罗的海深部生物圈病毒多样性研究

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sheng198208
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病毒作为海洋中丰度最高、多样性最丰富的生物类群,在海洋生态系统中占据重要的生态地位,不仅调控着海洋生物的多样性、群落结构和进化过程,还影响着海洋生物地球化学循环。目前,人们对海洋深部生物圈中的病毒知之甚少,本论文以波罗的海沉积物为研究对象,首先评估研磨珠对深部生物圈环境微生物DNA的提取效果。接着通过病毒标记基因psbA探索波罗的海沉积物中噬藻体及其宿主的多样性和群落结构,此外,还通过病毒标记基因g43分析沉积物中T4-like噬藻体的多样性和群落组成,以期丰富海洋沉积物病毒多样性的认知,为深入了解海洋沉积物病毒的多样性和生态地位等科学问题起参考作用。本论文研究结果如下:1.评估四组研磨珠A组(1.4mm陶瓷珠、0.1 mm二氧化硅球和1个4mm玻璃珠)、B组(0.1 mm和0.5 mm玻璃珠各0.6 g)、C组(0.5 mm玻璃珠1.2 g)和D组(0.1 mm玻璃珠1.2 g)对沉积物环境微生物DNA的提取效果,结果表明,对微生物丰度较高的沉积物样品而言,B组和C组提取能获得更高浓度的DNA,但四组研磨珠对微生物丰度低的沉积物样品提取效果无明显差别。2.基于psbA的研究结果表明,波罗的海沉积物中物种多样性高,主要类群是微型真核藻类、聚球藻肌尾病毒和聚球藻短尾病毒类群,其群落结构差异与地理环境有显著的相关性。靠近外海的59C和59E样品中的微生物群落多样性和丰富度更高,而位于波罗的海内部的65C和63E样品中具有更多特殊的微生物类群。3.基于g43的研究结果表明,波罗的海沉积物中T4-like噬藻体的整体丰富度较低,65C和63E站位的物种多样性比59E高。在地理分布上,三个站位间的噬藻体群落差异显著,而在垂直深度上,59E站位和63E站位内不同沉积深度的噬藻体多样性和群落结构也存在着显著的差异,尤其体现在63E的冰湖期和全新世沉积物。基于波罗的海的g43氨基酸序列构建的系统发育进化树可以划分为七大类群,不同站位样品共有的OTU明显分布在不同的类群。
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