绵羊IVF 8-细胞、16-细胞、桑椹胚阶段转录组研究

来源 :塔里木大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shaohuang321
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
绵羊卵裂期早期胚胎经历了受精卵形成、合子基因组激活、卵裂球压实等四个阶段,涉及胚胎转录结构的剧烈变化,研究8-细胞、16-细胞、桑椹胚阶段绵羊体外受精胚胎转录组,对了解早期胚胎生长发育规律十分重要。本研究为获得绵羊体外受精胚胎样本进行转录组测序,对绵羊体外受精培养体系进行优化;分别用单细胞裂解液和PicoPure?RNA Isolation Kit获得RNA,筛选有效单个胚胎RNA获取方法,纯化mRNA,将mRNA逆转录成cDNA,Smart-Seq2扩增cDNA构建绵羊IVF 8-细胞、16-细胞、桑椹胚期单个胚胎转录组测序文库,采用Illumina HiSeq Xten高通量测序技术进行转录组测序;筛选不同卵裂期胚胎差异表达基因,进行GO功能分析及KEGG分析。获得结果如下:1.在绵羊卵母细胞成熟培养液中添加10μg/mL的LH卵母细胞的成熟率为76.60%,卵裂率为63.24%,桑椹胚率为30.81%,显著高于添加0μg/mL、5μg/mL、15μg/mL、20μg/mL LH的成熟培养液(P<0.05)。2.用单细胞裂解液裂解绵羊单个胚胎,纯化mRNA,将mRNA逆转录成cDNA,Smart-Seq2扩增cDNA,检测PCR产物浓度均在60 ng以上,cDNA片段大小集中分布在1kbp~2 kbp之间,成功构建绵羊IVF 8-细胞、16-细胞、桑椹胚期单个胚胎转录组测序文库,而采用PicoPure?RNA Isolation Kit提取单个胚胎RNA,检测RNA质量,RIN<1.5且28S/18S<0.2,未满足cDNA扩增要求,无法构建转录组测序文库。3.用DEGSeq软件分析差异表达基因,以FC>2or<0.5且Q-value<0.05为筛选标准,8-细胞VS 16-细胞筛选到170条DEGs,其中上调126条,下调44条;16-细胞VS桑椹胚筛选找到417条DEGs,其中上调47条,下调370条;8-细胞VS桑椹胚筛选到126条DEGs,其中上调36条,下调90条。对差异表达基因进行GO生物功能分析,主要涉及核苷酸化合物合成、代谢调节、有机环化合物生物合成、RNA代谢、化合物代谢等生物过程。对差异表达基因进行KEGG分析结果显示,8-细胞VS 16-细胞DEGs参与到126条通路中,显著富集在癌症中转录失调、Hippo信号通路等11条代谢通路;16-细胞VS桑椹胚DEGs参与到206条代谢通路,显著富集在剪接体、调控干细胞多能性的信号通路2条代谢通路;8-细胞VS桑椹胚DEGs无显著富集代谢通路。
其他文献
中国是世界上苹果种植面积最大的国家,总产量约占世界苹果总产量的一半。但苹果收获季节性强,劳动力供给紧张,人工采收成本逐年增加,降低了苹果的经济竞争力。随着传统多维树
地基望远镜的空间目标在成像过程中受到大气湍流、传感器热噪声、空间微尘以及目标高速移动的影响,采集到的图像呈现一定程度的退化现象。为了从退化的数据中恢复质量更好的
目的:肝细胞癌仍有较高的死亡率和复发率,严重危害了人们的身体健康。研究表明,对肝癌患者进行分层管理可改善肝癌患者的预后。近年来研究证实长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)与多种肿瘤的发生发展密切相关,具有作为多种肿瘤预后标志物的潜力。lncRNAs相关预后风险模型已被用于预测肝癌患者的总生存期(Overall survival,OS)和无复发生存期(Relap
随着移动社交的发展,微信朋友圈中的公益众筹信息开始逐渐进入人们的视野。微信朋友圈基于现实生活中熟人关系的基础,将传统社会中的“人情”、“面子”、“关系”与微信社交媒体为代表的现代网络技术相结合,形成一个个由不同节点组成的信任关系网络,这也是基于微信社交媒体的公益众筹得以蓬勃发展的主要原因。然而,虚假公益事件的频发,表明公益众筹正面临着严重的信任危机。因此,对于社交媒体环境下公益众筹信任的研究刻不容
目的针对接受针刺联合生物反馈治疗的女性盆底松弛型便秘患者回顾性随访,观察治疗结束时(近期)和随访期间(远期)临床疗效,分析影响疗效的因素。方法回顾性分析2015年1月~2019
我国苹果苗木繁育实践中,无性系矮化砧木生根能力普遍较差,成为制约矮化砧木和优质大苗繁育的重要瓶颈问题。开展不定根发生的分子调控机制研究,对苹果无性系砧木繁育技术的
锂离子电池由于循环性能好、比能量高等优点成为了电网储能的首选。近年来电化学储能电站火灾事件频发,原因之一是个别单体电池工作异常,导致内部温度瞬时升高引发热失控。准
在虚拟现实和游戏引擎的研究中,渲染是呈现绚丽多彩图形效果的一项最重要技术。渲染的性能问题,一直随着应用场景的规模复杂性变大越显突出,面对许多场景复杂的海量数据往往
为了给采用永磁同步电机-滚珠丝杠式作动器的二级减振式主动悬架提供一种实用的二级减振结构,提出了一种外圈扁平化且内管上带有扩展板的衬套弹簧新结构。针对具体减振要求确
“监控+鞋印”是目前公安机关刑事侦查的重要技战法,其基本原理是依据犯罪现场鞋印推断嫌疑人所穿鞋样,然后到周边监控视频中检索嫌疑鞋样进而获得犯罪嫌疑人的图像信息,为案件侦查提供有效的线索。然而,当今这一技战法主要依靠人工来完成,效率十分低下,亟需一种以依据犯罪现场足迹得到的鞋样图像为基础,对犯罪现场周围不同场景监控视频中的鞋样图像进行自动匹配识别的方法,提高鞋样分析自动化程度,为追踪锁定犯罪嫌疑人提