按蚊亚属（Subgenus Anopheles）隶属于蚊科（Culicidae）,按蚊亚科（Anophelinae）,按蚊属（Genus Anopheles）,我国目前已记录有8个种团36种。本研究广泛收集我国按蚊亚属的蚊种,单蚊抽提基因组DNA,扩增和测定mtDNA-COⅡ、mtDNA-COⅠ、rDNA-28S-D3和rDNA-ITS2序列,应用Bioedit V5.0.9、ClustalX1.8.3、MEGA4.0、PAUP*4.0b10和MrBayesV3.1等软件包进行序列比对和特征分析,并构建各种间系统发育关系,系统发育树的重建采用距离法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法等4种方法。另外,本研究应用分子特征对我国辽宁省的赫坎按蚊种团进行了鉴别。取得以下主要结果：1.分别获得了41个体15种的mtDNA-COⅡ序列,33个体11种的mtDNA-COⅠ序列,69个体16种的rDNA-28S-D3序列和105个体16种的rDNA-ITS2序列。2.基于mtDNA-COⅡ基因序列的分析显示各按蚊种间具良好的解析度,重建的系统发育关系显示分为4支：第1支：（（（中华按蚊+比伦按蚊）+克莱按蚊+赫坎按蚊）+（（雷氏按蚊+贵阳按蚊）+（昆明按蚊+凉山按蚊）））+带足按蚊+（灰暗按蚊+筠连按蚊）【赫坎按蚊种团】；第2支：米赛按蚊；第3支：（傅氏按蚊+林氏按蚊）；第4支：须喙按蚊。3.基于rDNA-ITS2序列重建的按蚊种间系统发育关系的分析显示也分为4支：第1支：（（（（（比伦按蚊+中华按蚊）+克莱按蚊）+雷氏按蚊）+（（昆明按蚊+凉山按蚊）+贵阳按蚊））+（克劳按蚊+带足按蚊））+（（筠连按蚊+灰暗按蚊）+赫坎按蚊）)；第2支：米赛按蚊；第3支：（傅氏按蚊+朝鲜按蚊）：第4支：须喙按蚊。赫坎按蚊种团的赫坎按蚊、雷氏按蚊和贵阳按蚊位置与基于COⅡ的不同,其他蚊种位置稳定。4.COⅠ和D3序列的分析结果显示,该两种分子标志不适合重建按蚊亚属蚊种间系统发育关系。5.本研究共分子鉴别了我国辽宁省赫坎按蚊种团成员种168个个体,分别是中华按蚊（n=14）、雷氏按蚊（n=4）、八代按蚊（n=113）、比伦按蚊（n=2）和克莱按蚊（n=35）。克莱按蚊为我国的新记录种。