TAF15结合LINC00665通过SMD途径调控胶质瘤细胞生物学行为的机制研究

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目的:脑胶质瘤是原发恶性脑肿瘤中最常见和最致命的类型。根据世界卫生组织(World Health Organization,WHO)的分级标准分类,胶质瘤的病理级别分为低级别胶质瘤(I级-II级)和高级别胶质瘤(III级-IV级)。高级别胶质瘤极易浸润至人脑细胞外基质中,这种特性使手术切除和放化疗等传统治疗方法难以根治脑胶质瘤,脑胶质瘤复发率高、患者预后差,两年生存率仅为15%-26%。因此,寻找胶质瘤的生物标志物,以及针对胶质瘤的分子靶向治疗,已成为目前的热点研究。长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lnc RNAs)是一种长度大于200nt,无蛋白编码功能的内源性RNA分子,具有多种生物学特点及功能,在肿瘤发生发展过程中发挥重要调节作用。例如,lnc RNAs能够作为致癌因子或者肿瘤抑制因子,参与肿瘤细胞周期改变、增殖、凋亡、侵袭等生物学行为的调控。RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)是一类伴随RNA的调控过程,与RNA结合的蛋白质的总称。RBPs能与RNA组装成动态复合物,调控RNA生命周期的每个阶段。研究发现,由于RBPs功能障碍导致的RNA代谢改变可引起细胞转录组和蛋白质组的全局改变,从而影响肿瘤细胞生长、增殖、侵袭和凋亡。RBPs表达于多种肿瘤细胞,参与细胞生物学行为的调控。本研究明确了RBP-TAF15、lnc RNA-LINC00665、转录因子MTF1、YY2和靶蛋白GTSE1在胶质瘤组织和细胞中的表达水平,以及其对胶质瘤细胞生物学行为的影响;进一步,本研究探讨了上述因子间的作用方式,以及调节胶质瘤细胞生物学行为的分子机制。本研究旨在阐明胶质瘤发生发展调控的新分子机制,为胶质瘤治疗提供新的思路和新的靶标。研究方法:本研究中培养并应用人脑正常星型胶质细胞(Human brain astrocytes)—HA细胞,人胶质母细胞瘤细胞—U87和U251细胞,人胚胎肾细胞293T—HEK293T细胞。正常脑组织(Normal brain tissues,NBTs)和胶质瘤组织样本来源于中国医科大学附属盛京医院神经外科。采用实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,q RT-PCR)方法检测LINC00665、MTF1和YY2的表达水平。应用原位杂交技术检测LINC00665、MTF1和YY2在HA、U87和U251细胞中的分布和表达。采用Western blot方法检测TAF15、MTF1、YY2和GTSE1在NBTs、胶质瘤组织、HA细胞、U87和U251胶质瘤细胞中的表达水平。采用CCK-8实验检测U87、U251胶质瘤细胞增殖能力的变化。采用Transwell实验,检测胶质瘤细胞迁移、侵袭能力的变化。采用流式细胞术,检测胶质瘤细胞凋亡能力的变化。应用细胞转染的方法构建TAF15、LINC00665、MTF1、YY2和GTSE1过表达和/或表达沉默的细胞系。采用q RT-PCR方法检测TAF15、LINC00665、MTF1、YY2和GTSE1的表达变化。新生RNA实验检测LINC00665新生RNA表达变化。应用放射菌素D处理检测RNA半衰期的变化。采用RIP和RNA pull-down实验检测TAF15和LINC00665的结合作用。采用双荧光素酶基因报告实验,检测LINC00665和MTF1、LINC00665和YY2的结合作用与位点。采用染色质免疫沉淀技术,检测MTF1和GTSE1、YY2和GTSE1启动子区的直接结合作用与位点。裸鼠移植瘤实验检测TAF15、LINC00665、MTF1和YY2单独或联合干预对裸鼠皮下和原位移植瘤生长、以及裸鼠生存时间的影响。结果:本研究发现TAF15和LINC00665在胶质瘤组织和细胞中低表达,MTF1、YY2和GTSE1在胶质瘤组织和细胞中高表达。过表达TAF15、LINC00665,以及敲减MTF1、YY2、GTSE1均能显著抑制U87和U251细胞增殖,促进细胞凋亡,抑制细胞迁移、侵袭能力。TAF15靶向结合LINC00665,过表达TAF15显著增加LINC00665的稳定性,上调其表达;LINC00665通过SMD机制结合并降解MTF1、YY2的m RNA,降低MTF1、YY2的表达;MTF1、YY2分别与GTSE1的启动子区直接结合,下调的MTF1、YY2减弱了对GTSE1的转录促进作用,降低GTSE1的表达,进而抑制胶质瘤细胞的恶性生物学行为。联合应用TAF15、LINC00665过表达和MTF1、YY2敲减能够显著抑制裸鼠移植瘤的生长并延长裸鼠生存期。结论:1.TAF15通过结合LINC00665,增加其稳定性,发挥抑制胶质瘤细胞恶性生物学行为的作用。2.LINC00665分别与MTF1和YY2 m RNA 3’UTR区的Alu序列靶向结合,促进MTF1和YY2 m RNA的降解,发挥抑制胶质瘤细胞恶性生物学行为的作用。3.MTF1结合GTSE1的启动子区,转录促进GTSE1的表达,发挥促进胶质瘤细胞恶性生物学行为的作用。4.YY2结合GTSE1的启动子区,转录促进GTSE1的表达,发挥促进胶质瘤细胞恶性生物学行为的作用。5.TAF15/LINC00665/MTF1(YY2)/GTSE1轴在调节胶质瘤细胞生物学行为中发挥重要作用。
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