随机扩增多态性DNA技术鉴定双岐杆菌的研究

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhaoyuanhappy2008
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本文采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术在种及菌株水平上对双歧杆菌进行分类鉴定,并建立了相应的快速,可靠的双歧杆菌DNA提取方法。筛选到了一条在种和菌株水平上具有良好鉴别能力的RAPD引物S256,并用该引物对一株耐保藏双歧杆菌菌株进行了鉴定。此外还探讨了诸多因素对RAPD扩增结果的影响。主要结果如下: 1.建立了溶菌酶-SDS-醋酸钾法,溶菌酶-煮沸法两种快速,简便,安全的DNA提取方法。用这两种方法提取出的DNA作为RAPD扩增的模板,具有较好的扩增效果和重复性。 2.通过正交试验和完全交叉试验,确定了RAPD最优化扩增反应体系为:模板DNA浓度为50ng;Mg2+浓度为3mM;引物用量为10pmol;dNTP为200μM;Taq酶用量为1U以及扩增条件为:94℃变性30秒;36℃复性60秒;72℃延伸120秒;最后72℃延伸420秒。 3.通过对9株标准双歧杆菌菌株DNA的扩增,筛选出一个在种和菌株水平上都有良好分辨力的随机引物S256,其序列为CTGCGCTGGA。 4.采用属特异性常规PCR,生化试验,RAPD三种方法在属,种,菌株三个分类水平上鉴定出本试验室保存的一株耐保藏双歧杆菌为JCM1192短双歧杆菌。 5.对RAPD扩增结果有影响的诸因素进行了研究。实验表明,使用不同的PCR仪对扩增结果影响较大;不同厂家生产的Taq酶以及不同方法提取所得DNA对扩增结果有一定的影响;虽然不同方法提取所得DNA的RAPD图谱不完全相同,但同一种DNA自身的扩增重复性较好;一定范围内(30℃-40℃)的不同复性温度对扩增图谱影响不大;在其他条件不变的情况下,批内批间重复、由不同操作人员操作以及使用不同体积的PCR管对扩增结果无明显影响。
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