【摘 要】
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本研究以如何提高鸡肉的安全性和改善品质为主要目标,分别研究了益生芽孢杆菌LFB112的全基因组、替代抗生素效果和适宜添加量、对肉品质和肠道宏基因组层次上的菌群调控以及功能基因、肠道菌群结构变化与肉品质的关系,以初步阐明肠道菌群对肉品质调控的机理。试验一对芽孢杆菌LFB112基因组进行研究以阐明其广谱抑菌和益生特性的基因基础。试验由二代测序仪Hiseq2000进行shotgun测序,通过拼接、补洞等
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本研究以如何提高鸡肉的安全性和改善品质为主要目标,分别研究了益生芽孢杆菌LFB112的全基因组、替代抗生素效果和适宜添加量、对肉品质和肠道宏基因组层次上的菌群调控以及功能基因、肠道菌群结构变化与肉品质的关系,以初步阐明肠道菌群对肉品质调控的机理。试验一对芽孢杆菌LFB112基因组进行研究以阐明其广谱抑菌和益生特性的基因基础。试验由二代测序仪Hiseq2000进行shotgun测序,通过拼接、补洞等方法获得解淀粉芽孢杆菌LFB112的全基因组序列,并登录到NCBI上,登录号为CP006952。LFB112的基因组大小为3942754bp,GC 含量为 46.7%,不含有质粒。LFB112 共有 3961 个 CDS,94 个 tRNAs,和 10个rRNAs。基因组分析可知LFB112含有多个合成次级代谢物的基因簇,印证了其卓越的抑菌性能;其次含有丰富的水解酶基因,有利于营养物质的吸收利用。比较基因组分析该菌属于解淀粉芽孢杆菌植物亚种,与生防菌株CAU946亲缘关系最近,也证实了 LFB112的抗菌活性。此外,预测出5个基因岛,相对于该菌种的其它菌株而言,数量很少,显示出LFB112进化上的稳定性和应用上的安全性较好。试验二旨在探讨芽孢杆菌LFB112添加到肉鸡日粮中,对生长性能和鸡肉品质的影响。试验结果显示芽孢杆菌LFB112添加到肉鸡日粮中提高了肉鸡的平均日增重,改善肉色和脂肪酸组成等肉品质指标;对胴体性状、胸肌化学组分,剪切力等指标影响不显著。此外,芽孢杆菌LFB112在低剂量（107cfu/kg日粮）添加时,促生长效果最好,体增重略好于金霉素组。综合生长性能和肉品质的试验结果,可知饲喂芽孢杆菌LFB112的效果优于基础日粮组和金霉素组。试验表明芽孢杆菌LFB112可用在肉鸡饲粮中,替代抗生素,促进动物生长和健康,改善肉品质。试验三旨在通过饲喂芽孢杆菌LFB112动物肠道菌群结构和丰度的变化,阐明芽孢杆菌调控菌群的机制以及肠道菌群结构变化与肉品质的关系。研究采用Miseq测序技术,对芽孢杆菌组、抗生素组、和基础日粮组的肉鸡回肠和盲肠菌群的16S rRNA的V4-V5区进行测序,获得样本菌群的构成和丰度信息。结果发现基础日粮组菌群多样性没有降低,而是优势菌群,尤其是优势有益菌群不突出、丰度偏低。其次,基础日粮组菌群结构不稳定,变化幅度大。芽孢杆菌组在菌群多样性并未增加,而是加强回肠菌群结构稳定性和优势有益菌的丰度值,从而改善肉鸡的生长性能和肉品质。此外,多元相关分析结果显示第7天、21天和35天能动乳杆菌与胸肌脂肪酸组成之间具有显著的正相关,表明能动乳杆菌对胸肌脂肪酸的组成产生重要影响。
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