比较优势是竞争能力的基础和立足点，区域创新能力获取比较优势的内在基础是什么？一个区域要提高创新能力，从深层次看应具备什么条件?为什么有的区域技术资源虽然丰富，但创新能力却不高？一个区域的技术创新能力是否由该区域的创新微观主体—企业的技术创新能力的累计相加来得出?如何通过战略和政策变量的选择来改变一个区域的创新能力？这些就是本文力求回答的问题。根据对不同企业调查，并从区域技术创新活动产生的内在基础条件进行分析，初步结论可知区域创新能力是由该区域的技术能力与密切相关，本文把区域技术能力界定为“区域为支持技术创新战略实现，附着在内部人员、设备、信息、和创新组织中所有内生化技术知识存量的总和”，但现实中存在着一些区域技术能力与创新能力并不匹配的情况，所以区域创新能力并不是由区域技术能力单一决定的，它还与区域创新环境因子和创新资金投入有关。即使区域技术能力本身也不是由区域的创新微观主体—企业的技术能力的简单相加得出，因为区域技术的发展有三个普遍趋势：(1)区域化，(2)时间紧缩，(3)技术集成。这些将在以后的篇章详细解释，正是因为这些趋势的存在，使得区域技术自身发展为一个开放的系统，并与外部技术创新环境相互影响融合成为一个更大的系统。再加上创新资金投入的不确定性，三个因素共同构造了区域创新能力的系统复杂性。所以要去管理区域的创新过程将是一个困难重重而且充满风险的事情。仅仅强调区域创新的某一维度是远远不够的，因为区域技术、环境和资金之间互为依存、交错影响。所以本文借助于系统动力学的学科特点和优势来阐明这种互动的关系，当然首先是要把这些要素进行整合，融于一个统一的理论框架之中，然后是识别与区域创新相关的一系列联结关系，最后针对福建省特定环境下所存在的机会与约束，寻求支撑区域创新的有效结构与过程，并找出这个系统的高杠杆解来对创新系统产生重大的、持久的改善。