办学自主权问题是关系到民办高等院校核心竞争力的问题，对于民办高等院校的自身发展具有重要的意义。中国民办高等院校是市场经济发展的产物，是独立的法人主体，与公办高校相比，更需要拥有相对独立的自我支配、自我约束和自我发展的权利。只有被赋予这样的权利，民办高校才能在数量众多的公办高校的压力和竞争下，取得自己的一席之地。　　然而，政府将自己定位在民办高校领导者和管理者的高度，不将民办高校办学自主权看作是其应有的权利。在实际管理中，对民办高校行政干预工作过多。在实施高等学历教育的民办高校招生问题上，大部分地区仍然沿袭统一规划的方式;对于民办高校的学费多少，需要经过相关部门的批准公示;国家垄断民办高校的学历授予权，学历授予权由国家审定，带有明显的计划经济色彩。对民办高校的管理以公办高校的管理模式为参照物，剥夺了民办高校的自治权。　　对于这样的现状，要从政府、民办高校、社会三个方面进行改革，共同探寻落实民办高等院校办学自主权的途径。政府要转变职能，变管理型政府为服务型政府，分清权利，明确责任。同时制定、完善、落实相关的法律制度，保障民办高校的办学自主权;民办高校自身要理清思绪，树立自主、自律、自省的办学理念，完善内部的管理机制，恰当使用办学自主权，以真正的办学实力赢得社会大众的信任;社会则要以开放、公平的态度去对待民办院校，并积极建立教育中介评估管理机构，促进民办高校和公办高校在竞争的环境下，和谐健康发展。