目的：我国新农合存在卫生部门主管并经办(模式一)、人力社保部门主管并经办(模式二)、政府主管商业保险机构经办(模式三)等三种主要管理模式。研究新农合三种管理模式下的适宜支付方式可以为推进农村医疗卫生综合改革提供政策建议。本论文通过构建新农合支付相关利益均衡机制及实证分析浙江省新农合支付方式实施效果试图发现三种管理模式下门诊和住院适宜支付方式。方法：(1)通过文献回顾实现新农合支付方式相关概念界定和绩效目标定位；(2)运用利益相关者理论及博弈论构建构建三种管理模式下门诊和住院支付相关利益均衡机制；(3)采用专题小组讨论确定支付方式实施效果的评价指标；(4)运用秩和比法和TOPSIS法对浙江省新农合支付方式实施效果进行评价；(5)采用焦点访谈法分析支付方式改革中遇到的问题、成因及对策。结果：(1)博弈分析发现模式一门诊应选择按人头付费方式,住院应选择按病种付费方式；模式二门诊应选择总额预付制方式,住院应选择按病种付费方式；模式三门诊和住院都应选择总额预付制。(2)对浙江省新农合支付方式实施效果评价得出模式一门诊最优为次均费用限额方式,住院为按病种+次均费用限额组合方式;模式二门诊最优为次均费用限额方式,住院为总额预付制+按病种付费组合方式；模式三门诊最优为总额预付制方式,住院最优为按病种+次均费用限额组合方式。(3)研究发现经济发展水平好区域门诊最优为次均费用付费方式,住院为按病种付费方式；经济发展水平一般区域门诊最优为总额预付制+次均费用限额组合方式,住院为次均费用限额方式；经济发展水平较差区域门诊和住院最优均为按服务项目付费方式。结论：(1)研究显示模式一门诊应选择按人头付费方式,住院应选择按病种+按服务单元组合方式；模式二门诊应选择总额预付制方式,住院应选择总额预付制+按病种付费组合方式；模式三门诊应选择总额预付制方式,住院应选择总额预付制+按服务单元付费组合方式。(2)研究显示经济发展水平较好,门诊应选择后付制或预付制,住院应选择预付制或混合制；经济发展水平一般,门诊和住院应选择预付制或混合制；经济发展水平较差,门诊和住院应选择后付制。(3)促进支付方式从后付制向以预付制为主的混合支付方式改革；支付方式改革要与医疗机构体制机制改革联动进行；支付方式改革要从制度经济文化等方面多管齐下