在整个供应链中保持质量通常是水果生理学家和采后技术专家的主要目标。水果口味,香气,软化,色泽和糖酸混合物是非常重要的定性特征,对消费者的认可和水果在市场上的成功至关重要。然而,很少研究关注在番木瓜果实成熟期间的基因调控网络以及是否有相关基因参与到人工驯化中。在我们的研究中,我们使用二代测序来研究不同水果发育阶段栽培（ZhongBai）和非改良（AU9）番木瓜果实之间的基因表达变化。在栽培（ZhongBai）和非改良AU9番木瓜果实的三个发育阶段共鉴定出4607个差异表达基因（DEGs）。在绿色和成熟阶段的比分色阶段有更多的差异表达基因（DEGS）。使用blastp分析（Ee值为le-6的阈值）,通过比对葡萄基因组,总共3639个（79%）基因通过葡萄基因组成功注释。在ZhongBai的成熟和中白的绿色之间存在最多的差异表达基因,而最低的是在AU9成熟和AU9分色之间。与其相应的AU9阶段相比,更多的DEGs在ZB阶段被注释。基因本体（GO）富集分析显示,结合,氧化还原酶活性,转录因子和初级代谢显着富集。此外,与核苷酸,核酸结合,翻译起始以及核糖体相关的基因有大量表达,这表明可能果实成熟是在转录以及翻译水平上调控的。通过KEGG途径富集进一步分析差异表达基因,显示了 AU9和中ZhongBai品种中次生代谢产物,糖酵解,脂肪酸降解和苯丙素通路在决定果实风味中起作用。在我们的研究中萜类,类黄酮,类胡萝卜素相关基因在ZhongBai中的表达均高于Au9,而含硫氨基酸在AU9中比中白更多。脂肪酸降解和苯丙素途径是水果和木瓜中各种风味的挥发性前体的来源。另一方面,糖酵解在提供各种挥发性化合物的上游的碳骨架中起着至关重要的作用。这突出了水果风味和香气形成的复杂性,其中一种途径的产物作为另一种途径的合成前体。通过苯丙素途径的脂肪酸降解和氨基酸代谢有助于合成AU9和ZB挥发物,而糖酵解在补充脂肪酸和氨基酸代谢中的挥发物的前体中起着较大的作用。我们的研究对不同成熟阶段的风味化合物以及野生和栽培的番木瓜的生物合成途径进行了更多的研究,但需要进一步的研究来确定风味挥发物与番木瓜驯化之间是否存在关系。