随着知识经济和大数据时代的到来,创新能力在企业发展中的地位日益凸显,在党的十九大报告中,习近平总书记明确提出,要建立以企业为主体的创新体系,加强国家创新体系的建设,企业作为创新能力的主要贡献者,其创新活动一直备受关注。虽然我国是制造业大国,近年来,其研发投入呈逐年上升的趋势,但与研发强国相比,仍存在较大的差距,导致该现象的原因之一是委托代理问题。股权结构作为公司治理的基础,在理论上可以缓解委托代理问题,提高研发投入的转化效率,但是在实践中,股权结构的变化是否对研发活动与企业绩效的关系产生了影响,仍然是个未知数,这些都是亟须在实践中进行检验的问题。鉴于此,在回顾相关文献的基础上,首先阐述了制造业上市公司研发投入、股权结构与企业绩效的相关概念,论述了与其相关的理论,即技术创新理论、委托代理理论、信息不对称理论;其次分析了我国制造业上市公司研发投入、股权结构与企业绩效的现状,在此基础上,提出了研发投入与企业绩效、股权结构对研发投入与企业绩效关系的研究假设,构建了三者关系的回归模型;再次以2016——2018年我国沪深两市制造业上市公司为研究样本,采用多元回归分析研发投入、股权结构与企业绩效的关系,并进一步探讨股权结构对研发投入与企业绩效的调节作用。研究结果表明:(1)研发投入的增加,对企业滞后一期绩效产生了较大的积极影响;(2)股权结构对研发投入与企业绩效具有调节作用,其中,股权集中度会促进研发投入对企业绩效的提升作用,对研发投入与企业绩效的关系起到积极的调节作用;而股权制衡度与国有股权性质会抑制研发投入对企业绩效的提升作用,对研发投入与企业绩效的关系起到消极的调节作用。基于上述实证结论,本文提出在研发投入方面,企业应加大研发投入强度,加快科研成果的转化;政府应出台有利于研发活动的相关政策。在股权结构方面,企业应保持合理的股权结构,完善企业内部治理机制;政府应深化国企改制的相关建议。