我国证券市场自上世纪90年代建立以来,由于市场法律体系不完善、交易管理制度缺陷以及证券机构法人治理结构和自我守法合规意识不健全等原因,证券公司在早期经营中存在挪用客户保证金等问题。证券公司违规挪用证券客户交易结算资金从而形成巨额资金缺口,是导致证券公司频频破产的三重“原罪”之首。在证券行业逐步推行客户保证金存管制度改革成为必然趋势,所以研究我国客户保证金存管制度具有重要的理论意义和实践意义。本文主要采取理论研究和案例分析相结合,阐述了客户保证金存管制度的基本理论,通过对各种存管模式的利弊分析和我国客户保证金存管制度的发展历程引申出第三方存管制度推行的必然性。指出第三方存管制度是证券公司存管制度的改革方向,是保护客户资产,提高证券公司运营效率,适应市场创新的行业基础制度。接着通过对中信证券公司三方存管制度基本情况的介绍,阐述了第三方存管方案的设计原理、账户体系和运作框架等。全面分析第三方存管制度运行的实际效果和产生的实际问题,比如业务流程中各方协调压力,券商与银行的不平等竞争,账户规范遇到的法律纠纷,未来交收方式多样性和即时性对第三方存管制度的考验等。在目前的市场环境下,我国证券公司要抓住第三方存管制度改革机遇,规范经营管理,重视三方存管实施后带来的技术系统风险,及时调整完善结算交收制度,提高金融业务创新能力,拓宽经营领域,从“卖方业务”为主向“买方业务”为主转变,提高综合竞争实力,促进证券业乃至整个证券市场的健康和可持续发展。