目的:肝细胞癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）是最常见的原发性肝癌,尽管针对HCC的治疗手段和医疗资源在不断提升,但是其病死率仍居高不下。长链非编码RNA（Long noncoding RNA,lnc RNA）已经被国内外的研究专家证实是一类新型的肿瘤增殖、凋亡和转移调控因子。最近的研究发现肿瘤巨噬细胞的极化过程与肿瘤的发生发展息息相关,我们通过肿瘤巨噬细胞基因芯片分析,发现lnc RNA FOXP4-AS1在HCC中是一种功能性致癌基因,因此我们将进一步研究FOXPA-AS1在HCC中的预后意义,生物学影响方式以及调控网络。方法:1.诱导人类淋巴瘤细胞U937分化为M1和M2表型的巨噬细胞,将两种表型的巨噬细胞进行基因芯片分析,筛选出差异表达显著的lnc RNA FOXP4-AS1。分析FOXP4-AS1在HCC组织和与正常肝组织中的表达差异,收集HCC患者的临床病理资料和预后信息,确定其表达水平与病理指标和患者预后的相关性。2.设计si RNA小干扰片段,通过si RNA下调FOXP4-AS1,慢病毒转染肝癌细胞,构建稳定细胞株,进行CCK8增殖实验、划痕实验、克隆形成实验、Transwell实验、流式细胞仪检测细胞凋亡以及周期实验、TUNEL实验、血管生成实验等,检测FOXP4-AS1对肝癌细胞影响作用生物学方式。3.预测lnc RNA FOXP4-AS1差异表达的mirna（DEmi RNAs）以及DEmirna-mrna网络,其目的基因进行基因本体（GO）注释和KEGG（Kyoto Encyclopedia of genes and Genome）途径富集分析。建立蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,并利用Cytoscape软件对中心基因进行了鉴定。GEPIA数据库用于评估20个关键（hub）基因在肝癌中的表达和预后作用。c Bio Portal数据库用于显示基因的改变。构建一个lnc RNA FOXP4-mi RNA-m RNA的潜在调控网络。结果:1.FOXP4-AS1在HCC组织中相对正常肝组织呈高表达状态（P<0.05）。其表达量与血清甲胎蛋白（alpha-fetoprotein,AFP）、谷草转氨酶（aspartate aminotransferase,AST）、肿瘤大小、肝硬化、BCLC分期、患者年龄等具有相关性（P均<0.05）。Kaplan-Meier检验提示,肝癌组织中FOXP4-AS1表达水平较高的患者肝切除术后无瘤生存期和总生存期明显缩短（P均<0.05）。Cox回归分析进一步表明,FOXP4-AS1是肝切除术后患者无瘤生存期和总生存期的独立危险因素（P均<0.05）。2.通过设计si RNA对FOXP4-AS1沉默处理,进行功能实验验证。证实下调FOXP4-AS1的表达后能够明显减弱细胞的增殖能力和克隆能力,影响细胞周期,抑制肝癌细胞的侵袭、迁移以及促进血管生成的能力（P均0.05）。3.通过数据库交集,发现6个上调的和4个下调的DEmi RNA。选择高表达和低表达的预测靶基因（分别为183和147）进行GO注释和KEGG通路富集分析。低表达的基因在PI3K-Akt信号通路中显著富集;高表达的基因在细胞周期中显著富集。PPI网络显示IGFBP3和PRC1是节点度最高的枢纽基因。在HCC中,共计发现9个靶基因高表达和6个靶基因低表达后样本预后较差。结论:我们的结果提示lnc RNA FOXP4-AS1在HCC中为促癌基因,可能是参与HCC增殖、侵袭、迁移、细胞周期以及血管生成过程的关键调控因子,同时我们构建了HCC相关的lnc RNA FOXP4-AS1-mi RNA-m RNA调控网络,阐明参与HCC发生发展的分子机制。为寻找新的HCC治疗靶点和潜在预后生物标志物提供了新方向。