自公司治理理论提出以来，股权结构与公司绩效之间的相互关系，一直是公司治理理论中引人注目的问题之一。从20世纪90年代以来，国内外学者对中国上市公司的股权结构对公司治理绩效的影响，进行了广泛的研究。　　在以往的研究中大多学者采用单一变量来衡量上市公司治理绩效的问题，为更有效的对公司股权结构对公司治理绩效的影响进行研究，本文采用因子分析的方法，用“综合得分”这个变量归纳分析了反映公司治理绩效各个方面的15个财务指标。本文将“综合得分”设为被解释变量，股权结构设为解释变量，采用中国化肥农药行业A股上市公司数据，对有关上市公司股权结构对公司治理绩效影响的多个竞争性理论假设分别进行了检验。研究结论:样本公司的股权集中度、机构持股比例与样本公司的治理绩效之间呈显著正相关关系;而样本公司高管人员持股比例、样本公司是否被国家所控股与样本公司的治理绩效之间没有显著相关性。　　最后，我们根据本次研究的分析结论，提出了公司治理方面的参考政策建议，以期待对提高中国上市化肥农药公司治理绩效水平的提高有所帮助。