奶牛乳房炎是极其复杂的疾病，是影响奶牛业发展的重要因素。对奶牛乳房炎抗性的研究，有利于选育对乳房炎有高抗性的奶牛群。体细胞数(SCC)是用于提高乳房炎抗性的首选性状。高的SCC与乳房炎正相关，低的SCC与乳房炎负相关。因此可以通过降低SCC来实现抗病。在此基础上，一些学者研究了与SCC有关的微卫星标记，希望能用微卫星标记来辅助选择低SCC，从而达到选择高乳房炎抗性的个体的目的。本试验选择六个与体细胞数相关的微卫星座位BM6425、BM6458B、MS995、BMS1348、BMS1979和BM804，用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析其在200头山东荷斯坦奶牛中的遗传变异。计算了其等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数，并利用最小二乘法拟合线性模型，初步探索了这6个微卫星座位与山东荷斯坦奶牛牛乳中体细胞数的关系。结果表明：①6个微卫星在群体中的PIC、遗传杂合度和有效等位基因数的范围分别为0.7967～0.8839、0.7998～0.8852和4.9940～8.6972；②微卫星BM6425座位基因的等位基因184bp与体细胞数显著正相关，177bp与体细胞数显著负相关；③微卫星BMS1348座位基因型的等位基因106bp和92bp与体细胞数显著正相关，102bp、112bp和96bp与体细胞数显著负相关；④微卫星BM6458座位基因型的等位基因147bp、141bp与体细胞数显著正相关，128bp、145bp和143bp与体细胞数显著负相关；⑤微卫星BMS995座位基因型的等位基因125bp与体细胞数显著正相关，123bp、136bp、128bp和133bp与体细胞数显著负相关；⑥微卫星BM804座位基因型的等位基因157bp和154bp与体细胞数显著正相关，156bp、158bp和150bp与体细胞数显著负相关；⑦微卫星BMS1979座位基因型的等位基因105bp与体细胞数显著正相关，108bp、106bp和100bp与体细胞数显著负相关。