与外来猪相比，中国地方品种猪具有耐粗饲、抗逆性强、脂肪率高等性状。本论文利用PCR-DGGE和16SrDNA测序技术，比较研究了14日龄哺乳的巴马香猪、环江香猪、蓝塘猪、宁乡猪和长白猪的肠道内容物微生物组成的多样性差异，并利用实时定量PCR技术分析了其中17种与脂肪代谢相关细菌的数量差异，旨在为仔猪胃肠道菌群的调控提供理论依据。具体研究结果如下:　　 (1)PCR-DGGE分析结果表明，在回肠内容物细菌中，环江香猪条带数最多(25)，其次是巴马香猪(22)、长白猪(21)、宁乡猪(18)和蓝塘猪(12);在盲肠内容物细菌中，蓝塘猪条带数最多(29)，其次为宁乡猪(25)、环江香猪(24)、巴马香猪(22)和长白猪(17);在结肠内容物细菌中，环江香猪的条带数最多(23)，其次为巴马香猪(22)、宁乡猪(19)、长白猪(15)和蓝塘猪(14)，提示中国地方品种猪盲肠和结肠内容物微生物的多样性大于长白猪，但回肠差异不明显。　　 (2)16SrDNA克隆测序结果表明，回肠内容物细菌的克隆数，巴马香猪(18)＞环江香猪(17)＞宁乡猪(16)＞长白猪(12)＞蓝塘猪(6);盲肠内容物细菌的克隆数，巴马香猪(35)＞长白猪(24)＞环江香猪(23)＞宁乡猪(21)＞蓝塘猪(20);结肠内容物细菌的克隆数，巴马香猪(33)＞环江香猪(25)＞蓝塘猪(24)＞长白猪(23)＞宁乡猪(19)。三个肠段的优势菌群均为Lactobacillus，但其在回肠(51％～96％)、盲肠(31％～61％)和结肠(19％～56％)中的比例和种属数量均持续下降，而其他种属的细菌持续增加。在盲肠和结肠内容物中，宁乡猪的Lactobacillus比例均大于其他几个品种猪;长白猪回肠中Streptococcus的比例(21％)明显高于中国地方品种猪(0％～8％)。　　 (3)实时定量PCR分析结果表明，在回肠内容物微生物中，巴马香猪的双歧杆菌、大肠杆菌、柔嫩梭菌、产气荚膜梭菌、普氏菌和普拉梭杆菌含量最高，环江香猪的拟杆菌和厚壁菌含量最高，蓝塘猪的罗氏菌和球形梭菌含量最高，宁乡猪的乳酸杆菌、史氏甲烷短杆菌和球形梭菌-直肠真细菌含量最高，长白猪的链球菌、多形拟杆菌、金黄色葡萄球菌和Faecalibacteriumprausnitzii含量最高;在盲肠内容物微生物中，巴马香猪的多形拟杆菌、金黄色葡萄球菌、产气荚膜梭菌、普氏菌和史氏甲烷短杆菌含量最高，环江香猪的Faecalibacteriumprausnitzii、普拉梭杆菌和罗氏菌含量最高，蓝塘猪的球形梭菌、球形梭菌-直肠真细菌、拟杆菌和厚壁菌含量最高，宁乡猪的双歧杆菌、乳酸杆菌、链球菌、大肠杆菌和柔嫩梭菌含量最高。在结肠内容物微生物中，巴马香猪的球形梭菌、柔嫩梭菌、普氏菌、Faecalibacteriumprausnitzii和史氏甲烷短杆菌含量最高，环江香猪的厚壁菌门细菌含量最高，蓝塘猪的多形拟杆菌、金黄色葡萄球菌、球形梭菌-直肠真细菌和普拉梭杆菌含量最高，宁乡猪的双歧杆菌、乳酸杆菌、链球菌、大肠杆菌和罗氏菌含量最高，长白猪的产气荚膜梭菌和拟杆菌含量最高。　　 总之，每一品种猪都有其特定的微生物区系，中国地方品种猪盲肠与结肠微生物的多样性总体高于长白猪，巴马香猪和环江香猪具有相似的微生物区系，而宁乡猪的微生物区系具有其独立的特征;中国地方品种猪结肠内容物的拟杆菌门/厚壁菌门比值低于长白猪。上述结果有助于阐明不同品种猪具有不同表型的微生物学机制。