结香剂处理的白木香转录组测序及其倍半萜合酶基因的克隆和表达分析

来源 :海南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:crazy915
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
沉香来源为瑞香科植物含有树脂的干燥木材,具有极高的药用价值和经济价值。白木香(Aquilaria sinensis(Lour.)Spreng.)属于瑞香科(Thymelaeaceae)沉香属(AquilariaLam.)植物,为我国特有的珍惜贵重的药用植物,是我国出产沉香的最主要植物资源。目前,对于沉香的研究主要集中在沉香的化学成分及其结构的分析,但是沉香形成的分子机制尚不清楚。倍半萜是沉香的主要特征性成分之一,具有多种药用价值和生物活性。倍半萜合酶是倍半萜生物合成过程中重要的酶之一,深入研究倍半萜合酶的结构和功能,可以为将来运用生物技术手段来提高沉香的产量提供技术支撑,具有重要的理论和实际应用价值。本研究利用课题组专利结香剂处理的白木香茎干为实验材料进行转录组测序,通过对处理前后倍半萜合酶基因进行差异表达分析,克隆了一个沉香中的倍半萜合酶基因,并进行了该基因的生物信息学分析及表达分析。主要结果如下:(1)运用课题组专利结香剂处理白木香茎干并进行了转录组测序,总共获得191022503条clean reads,可能参与沉香倍半萜生物合成的差异表达基因41条,其中编号c32690_g1_i3的基因上调表达显著。(2)根据转录组测序分析结果获得的显著高上调表达的基因序列设计引物,运用RT-PCR克隆了白木香倍半萜合酶基因,长1632 bp,该基因编码543个氨基酸,Blast分析表明该阅读框编码蛋白与马来沉香(Aquilaria malaccensis)的倍半萜合成酶SesTPS1的氨基酸一致性为91%,命名为AsVS。(3)生物信息学分析表明AsVS具有倍半萜合酶的保守结构域DDXXD、NST/DTE和R(R)X8W,相对分子量约为62kD,理论等电点pI为5.57。系统进化树分析结果表明AsVS与马来沉香(Aquilariamalaccensis)的倍半萜合酶SesTPS1亲源关系最为接近,可达到91%,萜类合酶的聚类分析结果表明AsVS基因编码的蛋白属于Tpsa亚家族,即属于倍半萜合酶家族。(4)运用实时荧光定量PCR进行AsVS的表达分析,结果表明本课题组的专利结香剂处理促进了AsV 基因的表达。(5)通过构建原核表达载体pET28a-AsVS,并转化大肠杆菌BL21(DE3)中,用IPTG诱导蛋白表达,用镍亲和层析法进行蛋白纯化,对合成倍半萜的底物FPP进行催化,用GC-MS检测反应产物,未发现有倍半萜化合物。
其他文献
巴西橡胶树属于大戟科橡胶树属,是一种多年生的热带作物。本研究是以巴西橡胶树热研’7-33-97’品种为材料,利用荧光原位杂交技术或者原位PCR技术对Lespinasse等(2000)构建的
近年来,“脱贫攻坚”“西部大开发战略”“兴边富民行动”等建设都体现了国家对于边疆贫困地区的高度重视,瑶族作为生活在边疆地区的一个少小民族,国内关于其心理学方向的研究寥寥无几,云南中越边境的瑶族初中生在自我同一性发展的这个关键时期,一方面受中越文化差异的影响,一方面受到其他杂居少数民族的多元民族文化影响,这些影响让他们的民族认同、自尊和生活满意度呈现出怎样的分化,三者关系如何都是值得探讨的话题。边疆
学位
水稻优良不育系的选育是提高两系杂交水稻杂种优势、稻米品质的关键因素之一。航17S是通过空间诱变技术,将培矮64S干种子搭载2006年9月我国发射的“实践八号”农业卫星,经过
背景:研究发现慢性炎症可改变机体脂肪和脂蛋白代谢。炎症性肠病(IBD)作为一组慢性炎症性疾病,主要包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)。已有关于IBD患者出现血脂异常的研究报道。IBD患者的血脂异常可增加心血管事件发生的风险,但目前关于IBD患者的脂质谱改变仍存在争议,且针对此类研究较少。目的:探讨IBD患者和普通人群之间总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋
随着现代社会的高速发展,城镇化水平的不断推动,地域文化差异逐渐减少,导致城市与乡村越来越缺乏民族特色、地域特点和人文气息,甚至于人情味缺失。伴随着城市的日进发展,人们的生活水平不断提高,生活质量不断上升,但是我们在追求更高的生活品质的同时不能让城市与乡村原有的记忆被无情的抛弃,形成没有足够安全感的地域。这就需要我们在正确审视传统文化的基础上,通过不同的表现形式对民俗文化进行保护和传承。而场所精神的
本研究就草原革蜱和森林革蜱的形态和分子标记、中肠内容物菌群结构两方面进行了研究,结果如下:借助体视显微镜对草原革蜱和森林革蜱的体表形态、结构进行观察比较,而后基于COX1、ITS2、16S rDNA基因序列比较了二者的分子标志的异同。结果表明:两种蜱形态、结构具有一定差异,主要表现在体型、珐琅质和缘垛三方面;但是二者的COX1、ITS2、16S rDNA的序列极其相似,相似度依次为99.76%、9
巴西橡胶树生长发育过程受白粉菌侵染、风害、寒害和旱害等生物和非生物胁迫调控。由橡胶树粉孢菌引起的白粉病是橡胶树重要叶部病害之一。植物MYB转录因子家族参与发育、分
目的:研究先天性厚甲症患者及其家系基因突变情况,明确是否存在基因突变及突变基因位点,丰富该病基因谱及表型谱,为发病机制、遗传咨询及个体化治疗等提供理论依据。方法:选取先天性厚甲症患者1例,记录该患者及相关家系成员临床特征、病史、遗传史等情况,并进行体格检查,绘制系谱图。采集患者及相关家系成员外周血,提取基因组DNA,进行聚合酶链式反应(PCR)及DNA测序,明确基因突变的位点及类型;同时选取50名
目的:本研究以急性癫痫发作患者和戊四唑(PTZ)诱导的急性癫痫模型大鼠为研究对象,通过临床试验研究甘丙肽(GAL)、炎症因子与癫痫的关系,并通过动物实验研究甘丙肽2型受体(GalR2)激动剂AR-M1896对大鼠癫痫行为、海马CA3区组织病理学及脑内炎症因子水平的影响,从而探讨GalR2激动剂对癫痫发生发展的作用及可能机制。方法:临床试验:随机选取24例急性癫痫发作24小时内的患者(包括全面性发作
水稻抽穗期既是重要的农艺性状,直接决定了水稻品种的地区及季节适应性,又是复杂的数量性状,基因间普遍存在相互作用。因此,研究抽穗期的遗传机制具有重要的理论和实际意义。