目的:1、研究septin 9基因甲基化(mSEPT9)在中国乳腺癌患者诊断和新辅助化疗疗效评价中的应用价值。2、研究mSEPT9与乳腺癌临床病理特征及分子分型的相关性3、分析septin 9基因甲基化对SEPT9蛋白表达的影响。方法:1、应用双重实时PCR及亚硫酸盐转化技术对86例乳腺肿瘤穿刺活检样本(59例恶性肿瘤样本和27例良性肿瘤样本)及207例血液样本(80例乳腺癌患者、27例乳腺良性肿瘤患者及100例健康志愿者血浆样本)进行SEPT9基因甲基化检测。2、分析mSEPT9与乳腺癌临床病理特征及分子分型的相关性。3、对40例肿瘤组织切片进行免疫组织化学及免疫荧光染色以检测SEPT9蛋白表达情况。4、收集mSEPT9阳性乳腺癌患者新辅助化疗前及术后的血浆样本行mSEPT9检测,评价mSEPT9在乳腺癌新辅助化疗疗效评价中的应用价值。5、应用电化学发光免疫分析法测定血清CEA、CK19和CA15-3浓度,并比较它们与mSEPT9在乳腺癌诊断中的价值。结果:1、mSEPT9在乳腺癌组织中的阳性率(83.1%)明显高于良性乳腺肿瘤(8%),差异有统计学意义(p<0.001);mSEPT9在乳腺癌患者外周循环血液中的阳性率(26.3%)明显高于良性乳腺肿瘤病人(3.7%)及健康对照组(2%),差异有统计学意义(p=0.012)。2、mSEPT9在肿瘤组织中的表达与肿瘤直径大小(>2 cm)(p=0.026)、脂肪侵润(p=0.015)有关,差异有统计学意义;与患者年龄、性别、组织分型、临床分期、有无淋巴结、血管、神经侵犯等无关,差异无统计学意义;mSEPT9在乳腺癌患者外周循环血液中的表达与肿瘤临床分期(p=0.029)、淋巴结转移(p=0.018)、脂肪浸润(p=0.035)、Ki67(p=0.033)和p53(p=0.044)有关,差异有统计学意义;与患者年龄、性别、组织分型、临床分期、有无血管、神经侵犯等无关,差异无统计学意义。3、SEPT9蛋白表达水平与乳腺肿瘤甲基化之间呈负相关。4、新辅助化疗前后mSEPT9的状态变化分别与MP分级(p=0.001)、实体瘤反应评价标准(RECIST)(p<0.001)进行对比,均有统计学意义。5、在乳腺癌诊断方面,血浆mSEPT9的敏感性与血清CK19相当(p>0.05),差异无统计学意义,但优于CEA(p=0.002)和CA15-3(p<0.001),差异有统计学意义。结论:在乳腺癌组织中有相当一部分SEPT9基因发生了甲基化。SEPT9基因蛋白的表达及甲基化之间呈负相关,提示甲基化可以沉默其蛋白的表达。作为一种非侵入性血液乳腺癌生物标志物,虽然血浆mSEPT9的特异性足够高,但是它的灵敏度较低,提示该检测不足以作为乳腺癌筛查的方法。但在目前的形式下,血浆mSEPT9可以作为乳腺癌患者疗效评价的一个可靠的生物标志物。