目的:调查了解科技改革新形势下医学科研经费管理的现状及特点,分析探讨主要影响因素,为制定医学科研经费管理对策提供科学依据。方法:采用文献调研法对国内外科研经费管理相关文献的分析整理;以高校附属医院科研人员和科研管理人员为研究对象,采用专家访谈发对7名专家进行深度访谈,采用问卷调查法对311名科研人员、科管人员进行现况调查,从经费预算编制与调剂情况、经费开支与报销情况、经费管理的评价等方面,对新形势下医学科研经费管理现状进行研究,总结、归纳医学科研经费管理存在的主要问题,深入分析问题存在的原因,提出对策与建议。结果:发放调查问卷320份,收回调查问卷311份,回收率为97.2%,有效问卷311份,问卷有效率为100%。(1)经费预算编制与调剂方面:95.18%认为改革后的经费预算科目设置合理和基本合理;对预算科目的编制规定很熟悉的比例31.5%~46.6%;直接经费预算7个科目中,5个及以上科目预算编制都很熟悉占33.8%,7个科目预算编制都不熟悉占40.8%。预算编制的难点较高的是测试化验加工费(45.33%)、劳务费(40.84%)、材料费(40.51%)、预算科目的所占比例难以确定(39.87%)、会议费/差旅费/国际合作交流费(32.80%);经费预算支出合适的比例在38.7%-63.0%之间,偏低的比例在13.5%-59.6%之间。35.01%不太了解承担单位经费预算调剂程序;46.95%认为承担单位经费预算调剂流程不方便;主要原因为审批流程繁琐(89.67%)和审批时间过长(69.48%)。(2)项目经费开支与报销方面:80.13%认为科研经费能按时拨付;90.17%存在偶尔或经常实际经费支出无法正常报销,其中68.87%选择不再报销或自己垫付。报销困难的前三位科目是劳务费(35.35%)、测试化验加工费(32.32%)、会议费/差旅费/国际合作交流费(27.95%);42.76%认为科研经费报销手续不满意,且71.49%认为需要花较多的时间用于繁琐的经费报销事宜,原因是报销审批环节太多(88.89%),报销范围和报销标准不明确(68.01%),财务效率低排队耗时耗力(57.24%);80.81%能够及时了解自己承担项目的经费收入和支出情况,但仅有13.80%能够通过科研经费管理系统查询自己所承担项目的经费收支状况。(3)科研经费管理制度方面:47.27%不熟悉国家新颁布的科研经费改革政策,91.40%认为承担单位现行的科研经费管理办法较影响科研人员的积极性;75.88%的被调查者建议承担单位应设置科研财务助理岗位,经费支出和报销(87.46%)、项目预算编制和调剂(79.42%)和财务决算和验收(73.95%)占据科研财务助理应提供专业化服务前三位;52.73%的被调查者认为应在项目执行中期、后期开展绩效评价,评价指标应以论文、专利、著作等学术水平与促进经济增长、推动社会发展等相结合(70.74%);科研财务部门协同不紧密(67.85%)、信息系统不畅通(62.70%)、经费管理制度不健全(51.12%)、绩效评价体系不合理(46.62%)、内控监督体系不完善(37.62%)是被调查者认为新形势下科研经费管理仍存在的主要问题;经费使用过程中合理及时规范地调剂预算(69.77%)、经费预算编制的科学性(55.95%)、经费拨付与研究进度的协调性(52.41%)三方面是科研人员迫切希望在经费管理制度改革中进一步加以改进的问题。结论:科研人员对科研课题预算编制的相关规定熟悉程度不够,科研经费预算的调剂程序和要求不了解;经费报销手续满意度低,主要原因是报销审批环节太多、报销范围和报销标准不明确、财务效率低排队耗时耗力;科研财务部门协同不紧密、信息系统不畅通、经费管理制度不健全、绩效评价体系不合理和内控监督体系不完善是新形势下科研经费管理仍存在的主要问题;科研人员对国家新颁布的科研经费改革政策的熟悉程度不高,科研财务助理制度落实不够。对策与建议:一是深化经费管理制度改革,制定服务创新的经费使用制度体系;二是优化科研经费使用流程,建立科学规范的经费使用便捷路径;三是强化创新质量贡献导向,建立科学合理的经费使用绩效评价体系;四是加强经费管理内部协作,构建资源共享的经费使用信息交流平台。