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云南鳅属(Yunnanilus Nichols)隶属于鲤形目(Cypriniformes)，鳅科(Cobitidae)，条鳅亚科(NFemacheilinae)，是高原特有种类，主要分布在云南东北部南盘江水系，在云南省记录有22种，加上贵州草海和四川金沙江各记录1种，全国现有云南鳅24种。朱松泉(1986年)曾对11个属84个种和亚种的条鳅亚科的鳔和骨质鳔囊进行了研究，并探讨了其对条鳅亚科的演化及其在系统分类方面的意义。而目前关于云南鳅属鱼类的报道主要集中在新种的发现，关于分子系统学的研究还未见报道。
本文测定了11个种的线粒体cyt 6基因1140 bp和9个种的d-loop基因380 bp序列。cyt b基因序列没有插入/缺失，d-loop基因序列有11个插入/缺失。以花鳅亚科鱼类和高原鳅属鱼类为外群采用最大简约法、最大似然法及邻接法构建了云南鳅属鱼类的分子系统树。
基于我们的研究结果，对比前人的有关研究成果进行分析，得出以下结论：
1、云南鳅属是一个单系群；
2、沼泽云南鳅可能是云南鳅属鱼类中较原始的物种；
3、支持将云南鳅属鱼类分为两个群组的观点；
4、支持将虎斑云南鳅归为侧纹云南鳅群组的观点。