赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)为西北太平洋特有种,主要分布于中国东海与南海部分海域,是重要的商业捕捞对象之一,由于过度捕捞和疏于管理,其野生种群数量已严重下降,被世界自然保护联盟列入濒危物种红色名录中。目前人们对赤点石斑鱼种群的遗传结构和生物地理学信息了解甚少,本文对中国沿海赤点石斑鱼种群线粒体DNA(mtDNA)控制区内数目可变串联重复序列(VNTRs)的分布模式进行了较为深入地研究,旨在为该珍贵鱼种的保护和管理提供基础数据。　　主要研究结果如下:　　首先,从方法学上证明了采用适全的引物,PCR技术可以作为赤点石斑鱼mtDNA控制区内VNTRs异质性研究的可靠技术手段。　　其次,对6个种群264尾赤点石斑鱼的mtDNA控制区内VNTRs的分布模式、主拷贝分布模式、拷贝分布模式、每尾个体的拷贝分布模式等4个方面进行分析。结果显示:共有20种VNTRs组成形式,其中,17种以异质性形式存在,异质性个体数占总样品数的86％,在异质性个体中,以VNTRs由2-3-4拷贝组成模式最多(65/264);在异质性个体中,主拷贝为3拷贝的个体最多;在所有的VNTRs中,数量由多到少依次为3拷贝(226/705)、4拷贝(193/705)、2拷贝(127/705)、5拷贝(96/705)、1拷贝(41/705)、6拷贝(21/705)和7拷贝(1/705)。由此推测,赤点石斑鱼mtDNA控制区内3拷贝的VNTRs是最稳定的形式。　　系统发育树、AMOVA分析结果均显示,中国沿海的赤点石斑鱼没有明显的分化。蒙特尔测试分析表明,中国沿海赤点石斑鱼不具有明显的地理学特征。